More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0916 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0916  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
396 aa  758    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7662  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.65 
 
 
412 aa  296  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0456  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.07 
 
 
444 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0354  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.7 
 
 
354 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0932568  normal  0.0141277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.64 
 
 
359 aa  186  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2935  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  40.99 
 
 
297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37640  phosphate ABC transporter membrane protein  38.12 
 
 
364 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8333  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  39.85 
 
 
291 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0591  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.1 
 
 
299 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4263  phosphate ABC transporter permease  40.14 
 
 
354 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2742  phosphate ABC transporter permease  38.54 
 
 
361 aa  176  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00664487  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.96 
 
 
298 aa  171  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4650  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.22 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3424  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.74 
 
 
309 aa  163  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2962  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.6 
 
 
322 aa  163  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2080  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.71 
 
 
357 aa  162  9e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0364  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.12 
 
 
370 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.21 
 
 
358 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31850  phosphate ABC transporter membrane protein  39.72 
 
 
365 aa  160  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0660  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.26 
 
 
354 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3541  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.38 
 
 
304 aa  160  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.85 
 
 
694 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735974  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06960  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  34.11 
 
 
383 aa  159  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.97 
 
 
281 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4979  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.53 
 
 
359 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5090  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.31 
 
 
300 aa  153  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4900  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.16 
 
 
300 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79916  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2966  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.34 
 
 
317 aa  152  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4517  phosphate ABC transporter permease  34.16 
 
 
300 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.16 
 
 
300 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6819  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.22 
 
 
304 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0204  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.92 
 
 
369 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1070  phosphate ABC transporter permease  35.27 
 
 
332 aa  150  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1663  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.55 
 
 
300 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481341  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10948  phosphate-transport system integral membrane ABC transporter pstA1  37.81 
 
 
304 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2215  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  35.25 
 
 
306 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.136565 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0223  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  35.83 
 
 
345 aa  145  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1669  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.82 
 
 
278 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331352  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001264  phosphate transport system permease protein PstA  33.57 
 
 
287 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05139  molybdate ABC transporter permease protein  33.57 
 
 
287 aa  143  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  33.33 
 
 
627 aa  143  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1163  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.84 
 
 
280 aa  143  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3924  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.26 
 
 
317 aa  142  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0199  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.67 
 
 
277 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.998664  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1886  phosphate ABC transporter permease  36.4 
 
 
281 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0873  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.01 
 
 
303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.501959  normal  0.143992 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2104  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.82 
 
 
282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01630  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  41.08 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2590  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstA  36.09 
 
 
281 aa  141  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00589787  normal  0.413693 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5387  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.96 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.13 
 
 
294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2120  phosphate ABC transporter, permease protein  31.83 
 
 
284 aa  140  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.52 
 
 
604 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0820  phosphate ABC transporter permease  35.74 
 
 
291 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08641  putative phosphate ABC transporter  34.02 
 
 
297 aa  136  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1291  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.61 
 
 
284 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.66 
 
 
284 aa  133  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2342  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.17 
 
 
296 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367427  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.06 
 
 
279 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.239867  normal  0.961378 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0620  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  32.25 
 
 
274 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.363148  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2685  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.74 
 
 
301 aa  132  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206864  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3271  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.74 
 
 
301 aa  132  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176924  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2658  phosphate ABC transporter inner membrane protein  34.07 
 
 
297 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.249444  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1509  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.89 
 
 
276 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3145  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.07 
 
 
297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  33.71 
 
 
649 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25600  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  36.55 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0714898  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2166  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.07 
 
 
297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1095  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.76 
 
 
282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0990  phosphate ABC transporter, permease protein PstA, putative  31.88 
 
 
295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.164904  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.86 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0383637  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2812  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.56 
 
 
288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1438  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  35.86 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2479  phosphate ABC transporter permease  35.41 
 
 
293 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.721455 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1558  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.05 
 
 
276 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2333  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  37.77 
 
 
293 aa  131  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  38.69 
 
 
278 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0406  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  37 
 
 
283 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.914471  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.84 
 
 
284 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0067  phosphate ABC transporter, permease protein  32.04 
 
 
289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.191661  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1138  phosphate transport system permease protein 2  32.73 
 
 
281 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.743483  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0750  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  32.06 
 
 
286 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000021979  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_148  phosphate ABC transporter, permease protein  35.87 
 
 
283 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0728  phosphate ABC transporter permease  31.01 
 
 
297 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2268  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.84 
 
 
299 aa  130  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.85 
 
 
295 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271806  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1008  ABC-type phosphate transport system, permease component  32.98 
 
 
294 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07761  putative phosphate ABC transporter  31.01 
 
 
297 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.315399  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08651  putative phosphate ABC transporter  33.08 
 
 
297 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.14 
 
 
283 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.63 
 
 
646 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1958  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.27 
 
 
287 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2313  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.87 
 
 
294 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0140  phosphate ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 
283 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5182  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.12 
 
 
297 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4715  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.12 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.412253 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1274  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.24 
 
 
294 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07761  putative phosphate ABC transporter  31.01 
 
 
297 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0981  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.25 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0889131 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.39 
 
 
270 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>