183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3695 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3695  carbohydrate kinase  100 
 
 		 171 aa  354  3.9999999999999996e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0904  gluconate kinase  43.29 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.119231  decreased coverage  0.0000000668063 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02747  shikimate kinase  42.14 
 
 		 177 aa  134  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  37.25 
 
 		 169 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  36.6 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  35.71 
 
 		 429 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3845  gluconate kinase 1  35.4 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.518112 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  33.93 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3771  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  37.34 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  36.36 
 
 		 184 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0441  thermoresistant gluconokinase (gluconate kinase 2) protein  35.95 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.652705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  36.02 
 
 		 180 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4650  gluconate kinase 1  37.42 
 
 		 175 aa  107  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.648284 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0830  carbohydrate kinase  37.4 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4870  D-gluconate kinase  38.46 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0564228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4740  D-gluconate kinase  38.46 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0672986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4770  D-gluconate kinase  38.46 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.210509  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0983  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  39.69 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0150853  normal  0.264517 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0216  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  35.37 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4833  D-gluconate kinase  38.46 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4889  D-gluconate kinase  38.46 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  37.04 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  36.99 
 
 		 181 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0786  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  35.53 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.494269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1226  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  36.81 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3463  carbohydrate kinase  36.71 
 
 		 180 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  0.772653 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0278  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  33.75 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  37.65 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  36.81 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4753  gluconate kinase 1  33.75 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986563 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  36.81 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  36.81 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0276  gluconate kinase 1  33.75 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03288  gluconate kinase 2  33.75 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.609575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03241  hypothetical protein  33.75 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3636  gluconate kinase 1  33.75 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3915  gluconate kinase 1  33.75 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  37.41 
 
 		 175 aa  104  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0162  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  40.46 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5299  carbohydrate kinase thermoresistant glucokinase family  37.01 
 
 		 167 aa  103  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3888  gluconate kinase 1  33.75 
 
 		 175 aa  103  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1469  thermosensitive gluconokinase  37.76 
 
 		 178 aa  104  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3742  gluconate kinase 1  33.74 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  33.12 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3809  gluconate kinase 1  33.74 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3529  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  38.17 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3851  gluconate kinase 1  33.74 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3770  carbohydrate kinase  35.06 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2577  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  38.17 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3731  gluconate kinase 1  33.74 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3720  gluconate kinase 1  33.75 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4749  D-gluconate kinase  33.14 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04134  D-gluconate kinase, thermosensitive  33.14 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3729  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  33.14 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3661  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  36.08 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24180  gluconate kinase  35.62 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.0373923 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04098  hypothetical protein  33.14 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3367  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  35.54 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.000000649904 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2124  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  35.66 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4524  D-gluconate kinase  33.14 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0329306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  37.06 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  37.06 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0379  gluconate kinase  34.69 
 
 		 172 aa  101  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127546  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1046  gluconate kinase  35.67 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000585509  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  36.11 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0770  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  37.12 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1135  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  34.38 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0310526 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  37.21 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6828  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  37.4 
 
 		 207 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  35.86 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  35.42 
 
 		 164 aa  99  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3943  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  35.42 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  34.62 
 
 		 176 aa  98.6  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3911  gluconate kinase 1  33.13 
 
 		 164 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.652303 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2443  thermoresistant gluconokinase  33.73 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0359  thermoresistant gluconokinase  33.73 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1217  thermoresistant gluconokinase  33.73 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3403  putative thermoresistant gluconokinase  33.73 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3437  putative thermoresistant gluconokinase  33.73 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2628  thermoresistant gluconokinase  33.73 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0043609  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  31.95 
 
 		 185 aa  98.2  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3878  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  34.18 
 
 		 180 aa  97.8  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.689499  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1082  gluconate kinase  37.4 
 
 		 168 aa  97.8  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2939  gluconokinase  35.81 
 
 		 173 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3436  carbohydrate kinase  36.64 
 
 		 166 aa  97.8  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0352  thermoresistant gluconokinase  37.4 
 
 		 168 aa  97.4  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.947295  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3644  carbohydrate kinase  36.99 
 
 		 162 aa  97.4  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2408  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  36.92 
 
 		 176 aa  97.1  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.949742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3439  shikimate kinase  33.94 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0926  gluconate kinase  31.74 
 
 		 202 aa  97.1  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4056  carbohydrate kinase  34.69 
 
 		 191 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  34.72 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1220  thermoresistant gluconokinase  33.73 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4087  carbohydrate kinase  34.01 
 
 		 191 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  34.01 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4174  carbohydrate kinase  34.01 
 
 		 191 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  31.82 
 
 		 182 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3198  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  31.45 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000236698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  35.11 
 
 		 167 aa  95.9  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  33.1 
 
 		 185 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>