26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2489 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2489  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  236  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.728514  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1463  hypothetical protein  29.41 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0085  hypothetical protein  38.04 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00288906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0015185  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21250  hypothetical protein  27.08 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1321  protein of unknown function DUF1312  30.83 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0562  hypothetical protein  31.5 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1954  hypothetical protein  34.94 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0036  hypothetical protein  27.27 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0349  protein of unknown function DUF1312  26.72 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1528  hypothetical protein  32.74 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000003148  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1618  protein of unknown function DUF1312  53.85 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1083  hypothetical protein  27.05 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.045853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1114  protein of unknown function DUF1312  43.59 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0528  hypothetical protein  26.8 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.174497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0352  hypothetical protein  23.01 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.849251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2907  hypothetical protein  25.21 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2362  hypothetical protein  30.51 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.684289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1500  protein of unknown function DUF1312  28.57 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126539  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2904  protein of unknown function DUF1312  24.41 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0069  hypothetical protein  25.58 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1524  protein of unknown function DUF1312  30.43 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3079  hypothetical protein  26.37 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0959  hypothetical protein  23.81 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0692  protein of unknown function DUF1312  22.99 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0212  hypothetical protein  32.95 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>