15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1528 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1528  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  247  5e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000003148  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0212  hypothetical protein  44.09 
 
 
112 aa  84  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1238  hypothetical protein  37.1 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1217  hypothetical protein  37.1 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1462  hypothetical protein  34.44 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1524  protein of unknown function DUF1312  45.16 
 
 
135 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2489  hypothetical protein  32.93 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.728514  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1463  hypothetical protein  31.73 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0670  hypothetical protein  30.33 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0015185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14290  hypothetical protein  36.71 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.90798e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0562  hypothetical protein  25.78 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0349  protein of unknown function DUF1312  27.43 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1083  hypothetical protein  31.03 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.045853  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2904  protein of unknown function DUF1312  28.24 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0085  hypothetical protein  34.04 
 
 
140 aa  42.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00288906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>