29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1954 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1954  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  253  7e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0772  hypothetical protein  29.82 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101313  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0069  hypothetical protein  37.14 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14290  hypothetical protein  31.3 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.90798e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0528  hypothetical protein  32.67 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.174497  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0562  hypothetical protein  28.35 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0670  hypothetical protein  31.09 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0015185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0036  hypothetical protein  32.61 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0352  hypothetical protein  29.84 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.849251  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1618  protein of unknown function DUF1312  40 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0085  hypothetical protein  32.22 
 
 
140 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00288906  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0692  protein of unknown function DUF1312  31.18 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1114  protein of unknown function DUF1312  32.98 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2904  protein of unknown function DUF1312  27.91 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2907  hypothetical protein  29.46 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1990  protein of unknown function DUF1312  30.71 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000033613  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2489  hypothetical protein  35.37 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.728514  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2403  hypothetical protein  30.1 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0349  protein of unknown function DUF1312  35 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21250  hypothetical protein  28.71 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1524  protein of unknown function DUF1312  28.26 
 
 
135 aa  53.5  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1500  protein of unknown function DUF1312  32.93 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3079  hypothetical protein  27.52 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0236  hypothetical protein  31.4 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2362  hypothetical protein  25.42 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.684289  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1462  hypothetical protein  41.86 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1217  hypothetical protein  38.18 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1238  hypothetical protein  38.18 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1083  hypothetical protein  26.37 
 
 
144 aa  41.6  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.045853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>