20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1321 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1321  protein of unknown function DUF1312  100 
 
 
130 aa  264  2.9999999999999995e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21250  hypothetical protein  34.67 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1083  hypothetical protein  36.59 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.045853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0085  hypothetical protein  36.52 
 
 
140 aa  62  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00288906  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1463  hypothetical protein  35.51 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0562  hypothetical protein  29.2 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2489  hypothetical protein  34.43 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.728514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0670  hypothetical protein  31.9 
 
 
118 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0015185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0036  hypothetical protein  26.55 
 
 
126 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0349  protein of unknown function DUF1312  28.04 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1114  protein of unknown function DUF1312  32.22 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2362  hypothetical protein  30.63 
 
 
124 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.684289  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0528  hypothetical protein  24.59 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.174497  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3079  hypothetical protein  31.13 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1990  protein of unknown function DUF1312  22.88 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000033613  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2403  hypothetical protein  24.58 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0692  protein of unknown function DUF1312  29.59 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1524  protein of unknown function DUF1312  28.16 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0069  hypothetical protein  28.95 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0959  hypothetical protein  24.19 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>