32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1524 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1524  protein of unknown function DUF1312  100 
 
 
135 aa  264  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0562  hypothetical protein  43.51 
 
 
126 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1500  protein of unknown function DUF1312  40.96 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126539  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0670  hypothetical protein  27.78 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0015185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1114  protein of unknown function DUF1312  48.33 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2904  protein of unknown function DUF1312  30.23 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1083  hypothetical protein  29.63 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.045853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14290  hypothetical protein  31.3 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.90798e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0069  hypothetical protein  30.08 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1217  hypothetical protein  32.56 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1238  hypothetical protein  32.56 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0349  protein of unknown function DUF1312  40.91 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0085  hypothetical protein  28.41 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00288906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1954  hypothetical protein  28.26 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1618  protein of unknown function DUF1312  33.72 
 
 
115 aa  53.9  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0692  protein of unknown function DUF1312  26.8 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0528  hypothetical protein  29.52 
 
 
120 aa  52.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.174497  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1528  hypothetical protein  30.77 
 
 
123 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000003148  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2362  hypothetical protein  34.48 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.684289  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0036  hypothetical protein  27.27 
 
 
126 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1321  protein of unknown function DUF1312  29.23 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000102941  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0772  hypothetical protein  26.52 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0236  hypothetical protein  27.47 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1990  protein of unknown function DUF1312  27.42 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000033613  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1462  hypothetical protein  43.24 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3079  hypothetical protein  25.93 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0352  hypothetical protein  32.26 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.849251  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2403  hypothetical protein  28.57 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2907  hypothetical protein  22.96 
 
 
125 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1463  hypothetical protein  29.89 
 
 
135 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227695  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2489  hypothetical protein  30.43 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.728514  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0959  hypothetical protein  29.41 
 
 
116 aa  40  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>