22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1238 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1217  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1238  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1528  hypothetical protein  37.1 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000003148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1462  hypothetical protein  42.39 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0212  hypothetical protein  45.78 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14290  hypothetical protein  34.11 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.90798e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0562  hypothetical protein  28.46 
 
 
126 aa  50.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1524  protein of unknown function DUF1312  37.7 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0772  hypothetical protein  25.78 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2904  protein of unknown function DUF1312  40 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0349  protein of unknown function DUF1312  36.21 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0085  hypothetical protein  34.33 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00288906  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1114  protein of unknown function DUF1312  37.93 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0692  protein of unknown function DUF1312  38.33 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1954  hypothetical protein  38.18 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1618  protein of unknown function DUF1312  45.24 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0528  hypothetical protein  32.2 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.174497  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1083  hypothetical protein  34.69 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.045853  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0036  hypothetical protein  26.17 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1990  protein of unknown function DUF1312  26.61 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000033613  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0670  hypothetical protein  25.49 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0015185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0069  hypothetical protein  35.71 
 
 
124 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>