32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0562 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0562  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  254  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1524  protein of unknown function DUF1312  41.46 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1500  protein of unknown function DUF1312  44.57 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126539  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0692  protein of unknown function DUF1312  38.04 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0670  hypothetical protein  33.05 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0015185  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2904  protein of unknown function DUF1312  30.77 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14290  hypothetical protein  33.9 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.90798e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0349  protein of unknown function DUF1312  46.3 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0085  hypothetical protein  33 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00288906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1954  hypothetical protein  28.35 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1114  protein of unknown function DUF1312  46.55 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2362  hypothetical protein  35.09 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.684289  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2403  hypothetical protein  26.98 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1321  protein of unknown function DUF1312  29.2 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000102941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1990  protein of unknown function DUF1312  33.88 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000033613  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0772  hypothetical protein  25.2 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101313  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0528  hypothetical protein  27.69 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.174497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0036  hypothetical protein  24.78 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0069  hypothetical protein  25.98 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0236  hypothetical protein  28.7 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1463  hypothetical protein  29.63 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227695  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2489  hypothetical protein  29.41 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.728514  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1217  hypothetical protein  28.46 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1238  hypothetical protein  28.46 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1462  hypothetical protein  38.46 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3079  hypothetical protein  32.2 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0352  hypothetical protein  22.88 
 
 		 120 aa  47.4  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.849251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1083  hypothetical protein  33.93 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.045853  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21250  hypothetical protein  25.23 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1528  hypothetical protein  25.78 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000003148  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1618  protein of unknown function DUF1312  37.78 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2907  hypothetical protein  22.83 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>