25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1114 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1114  protein of unknown function DUF1312  100 
 
 
130 aa  268  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0562  hypothetical protein  31.67 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1954  hypothetical protein  33.62 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1524  protein of unknown function DUF1312  48.33 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1321  protein of unknown function DUF1312  28.68 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000102941  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1462  hypothetical protein  35.09 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0670  hypothetical protein  46.51 
 
 
118 aa  53.9  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0015185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1500  protein of unknown function DUF1312  48.84 
 
 
129 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126539  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0692  protein of unknown function DUF1312  29.21 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0085  hypothetical protein  32.39 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00288906  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2362  hypothetical protein  32.28 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.684289  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1618  protein of unknown function DUF1312  43.18 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1238  hypothetical protein  26.13 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1217  hypothetical protein  26.13 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0349  protein of unknown function DUF1312  39.47 
 
 
122 aa  47  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2489  hypothetical protein  43.59 
 
 
123 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.728514  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0528  hypothetical protein  32.47 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.174497  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1463  hypothetical protein  23.15 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227695  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0772  hypothetical protein  26.55 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101313  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1990  protein of unknown function DUF1312  25.22 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000033613  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0036  hypothetical protein  31.67 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2904  protein of unknown function DUF1312  25.36 
 
 
143 aa  42  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1083  hypothetical protein  27.91 
 
 
144 aa  41.6  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.045853  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0236  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0352  hypothetical protein  26.17 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.849251  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>