33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0036 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0036  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  254  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0069  hypothetical protein  37.78 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2403  hypothetical protein  32.48 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3079  hypothetical protein  32.97 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1954  hypothetical protein  32.61 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0528  hypothetical protein  34.86 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.174497  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21250  hypothetical protein  32.97 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0772  hypothetical protein  31.52 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101313  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0352  hypothetical protein  43.75 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.849251  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0085  hypothetical protein  32.14 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00288906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0562  hypothetical protein  24.78 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1321  protein of unknown function DUF1312  26.55 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000102941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0670  hypothetical protein  36 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0015185  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2489  hypothetical protein  30.86 
 
 
123 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.728514  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1618  protein of unknown function DUF1312  37.04 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2907  hypothetical protein  31.48 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1524  protein of unknown function DUF1312  27.27 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14290  hypothetical protein  22.66 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.90798e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0236  hypothetical protein  24.59 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2904  protein of unknown function DUF1312  34.92 
 
 
143 aa  47.4  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1462  hypothetical protein  26.97 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1463  hypothetical protein  23.28 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227695  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1083  hypothetical protein  27.27 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.045853  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0692  protein of unknown function DUF1312  27.37 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0349  protein of unknown function DUF1312  37.84 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0959  hypothetical protein  21.3 
 
 
116 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1114  protein of unknown function DUF1312  27.17 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1500  protein of unknown function DUF1312  30 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1990  protein of unknown function DUF1312  26.72 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000033613  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1217  hypothetical protein  26.17 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1238  hypothetical protein  26.17 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0212  hypothetical protein  22.22 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2188  hypothetical protein  24.36 
 
 
120 aa  40.8  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.795141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>