17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21250 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_21250  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  288  3e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1321  protein of unknown function DUF1312  30.17 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2489  hypothetical protein  27.17 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.728514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0670  hypothetical protein  36.99 
 
 
118 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0015185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0036  hypothetical protein  30.39 
 
 
126 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1954  hypothetical protein  28.57 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0349  protein of unknown function DUF1312  30.28 
 
 
122 aa  50.8  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0692  protein of unknown function DUF1312  35.82 
 
 
133 aa  50.4  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0085  hypothetical protein  32.35 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00288906  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0352  hypothetical protein  27.18 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.849251  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3079  hypothetical protein  29.7 
 
 
123 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0562  hypothetical protein  23.14 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1463  hypothetical protein  25.4 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227695  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1083  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.045853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14290  hypothetical protein  23.89 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.90798e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0069  hypothetical protein  28.71 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0772  hypothetical protein  26.26 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>