22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0352 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0352  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  238  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.849251  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2907  hypothetical protein  49.6 
 
 
125 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0528  hypothetical protein  45.13 
 
 
120 aa  90.5  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.174497  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0772  hypothetical protein  48.18 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101313  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0069  hypothetical protein  43.1 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2403  hypothetical protein  36.07 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3079  hypothetical protein  34.91 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1954  hypothetical protein  29.84 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14290  hypothetical protein  27.27 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.90798e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0036  hypothetical protein  43.75 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1500  protein of unknown function DUF1312  37.62 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126539  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1618  protein of unknown function DUF1312  30.49 
 
 
115 aa  53.5  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0085  hypothetical protein  31.25 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00288906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0670  hypothetical protein  40.38 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0015185  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21250  hypothetical protein  31.82 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0562  hypothetical protein  22.88 
 
 
126 aa  47.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0236  hypothetical protein  26.26 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0959  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1524  protein of unknown function DUF1312  32.26 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2489  hypothetical protein  26.44 
 
 
123 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.728514  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0349  protein of unknown function DUF1312  44 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1990  protein of unknown function DUF1312  23.2 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000033613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>