22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3079 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3079  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  249  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0352  hypothetical protein  35.4 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.849251  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0036  hypothetical protein  32.69 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0772  hypothetical protein  27.27 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101313  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1463  hypothetical protein  29.36 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227695  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1321  protein of unknown function DUF1312  30.71 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1954  hypothetical protein  26.15 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0670  hypothetical protein  26.27 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0015185  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0528  hypothetical protein  27.68 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.174497  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0069  hypothetical protein  23.77 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0562  hypothetical protein  26.19 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0085  hypothetical protein  35.48 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00288906  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2907  hypothetical protein  25.21 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1083  hypothetical protein  47.5 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.045853  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21250  hypothetical protein  29.7 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2188  hypothetical protein  28.42 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.795141  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1618  protein of unknown function DUF1312  32.39 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1524  protein of unknown function DUF1312  28.38 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0236  hypothetical protein  22.64 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2904  protein of unknown function DUF1312  24.81 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2489  hypothetical protein  26.37 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.728514  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1462  hypothetical protein  31.82 
 
 
124 aa  40  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>