19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1463 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1463  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  273  4e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227695  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1083  hypothetical protein  38.89 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.045853  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0349  protein of unknown function DUF1312  30.7 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0085  hypothetical protein  45.61 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00288906  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1321  protein of unknown function DUF1312  35.51 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2362  hypothetical protein  32.79 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.684289  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0670  hypothetical protein  36.96 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0015185  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2489  hypothetical protein  27.27 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.728514  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3079  hypothetical protein  29.47 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0562  hypothetical protein  29.63 
 
 
126 aa  50.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0692  protein of unknown function DUF1312  35.71 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1528  hypothetical protein  31.73 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000003148  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0528  hypothetical protein  23.3 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.174497  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0069  hypothetical protein  24.07 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0036  hypothetical protein  23.28 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21250  hypothetical protein  35.59 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1618  protein of unknown function DUF1312  42.86 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1524  protein of unknown function DUF1312  29.89 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1114  protein of unknown function DUF1312  23.53 
 
 
130 aa  40  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>