18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2362 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2362  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  247  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.684289  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0692  protein of unknown function DUF1312  38.46 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0670  hypothetical protein  33.9 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0015185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0562  hypothetical protein  35.09 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0085  hypothetical protein  39.08 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00288906  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1463  hypothetical protein  32.79 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227695  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1321  protein of unknown function DUF1312  30.63 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000102941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1524  protein of unknown function DUF1312  34.48 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1990  protein of unknown function DUF1312  32.2 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000033613  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1954  hypothetical protein  25.42 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1083  hypothetical protein  27.85 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.045853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1114  protein of unknown function DUF1312  30.91 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1618  protein of unknown function DUF1312  29.35 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14290  hypothetical protein  29.03 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.90798e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2489  hypothetical protein  40.32 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.728514  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2904  protein of unknown function DUF1312  21.67 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1500  protein of unknown function DUF1312  29.76 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126539  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0349  protein of unknown function DUF1312  23.53 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>