271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0165 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0165  NADH-quinone oxidoreductase chain j  100 
 
 
164 aa  309  1e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4079  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  36.94 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965894  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4235  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  34.5 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000857433  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1292  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  34.36 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0347  NADH dehydrogenase I, J subunit  33.72 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7010  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  36.02 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1307  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  34.57 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4001  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  33.53 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.34885e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3346  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  34.66 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.605889  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3917  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  32.94 
 
 
167 aa  72  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4347  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  34.67 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461069  normal  0.167127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1040  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  33.93 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0160  NADH dehydrogenase subunit J  32.35 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0918  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  33.74 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7682  NADH dehydrogenase subunit J  33.96 
 
 
287 aa  67.8  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1237  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  31.52 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2410  NADH dehydrogenase subunit J  32.12 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3129  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  32.32 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4198  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  31.76 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0547  NADH dehydrogenase subunit J  33.33 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.424646  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4353  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  31.76 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502701  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01761  NADH dehydrogenase subunit J  31.76 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1751  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  32.2 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4330  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  31.76 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01781  NADH dehydrogenase subunit J  31.76 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3215  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  33.72 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01871  NADH dehydrogenase subunit J  32.74 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1373  NADH dehydrogenase I chain J  35.54 
 
 
169 aa  63.9  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00182046  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1245  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  30.95 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5107  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  31.17 
 
 
184 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3407  NADH dehydrogenase subunit J  28.3 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2504  NADH dehydrogenase subunit J  36.9 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2459  NADH dehydrogenase subunit J  36.9 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1535  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  31.55 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1151  NADH dehydrogenase I chain J  29.14 
 
 
211 aa  63.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3630  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  28.22 
 
 
166 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2559  NADH dehydrogenase subunit J  36.9 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0464102  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2666  NADH dehydrogenase subunit J  36.9 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2548  NADH dehydrogenase subunit J  36.9 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6085  NADH dehydrogenase subunit J  35.46 
 
 
323 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302185  normal  0.0550219 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2824  NADH dehydrogenase subunit J  36.9 
 
 
184 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0975508  normal  0.999371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02205  NADH dehydrogenase subunit J  36.9 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1377  NADH dehydrogenase (quinone)  36.9 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0544601  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2434  NADH dehydrogenase subunit J  36.9 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2429  NADH dehydrogenase subunit J  36.9 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3419  NADH dehydrogenase subunit J  36.9 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2656  NADH dehydrogenase subunit J  36.9 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02165  hypothetical protein  36.9 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2573  NADH dehydrogenase subunit J  36.9 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1372  NADH dehydrogenase subunit J  36.9 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.780748  normal  0.259355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3386  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  35.26 
 
 
170 aa  61.6  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.836495  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2542  NADH dehydrogenase (quinone)  35.88 
 
 
181 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1525  NADH dehydrogenase subunit J  33.53 
 
 
200 aa  61.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1500  NADH dehydrogenase subunit J  35.33 
 
 
186 aa  60.8  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01751  NADH dehydrogenase subunit J  32.12 
 
 
200 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.233324  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1926  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  29.38 
 
 
282 aa  60.5  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.856585  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1402  NADH dehydrogenase (quinone)  36.31 
 
 
183 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.363648  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2764  NADH dehydrogenase subunit J  34.13 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.148334  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02311  NADH dehydrogenase subunit J  33.53 
 
 
200 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0282  NADH dehydrogenase subunit J  29.7 
 
 
200 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0983  NADH dehydrogenase subunit J  31.87 
 
 
293 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1013  NADH dehydrogenase subunit J  32.7 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0592  NADH dehydrogenase I, J subunit  37.38 
 
 
239 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0829267  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3295  NADH dehydrogenase subunit J  29.76 
 
 
173 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1436  NADH dehydrogenase subunit J  35.17 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0995  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  26.22 
 
 
197 aa  58.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0477  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  27.27 
 
 
169 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0581  NADH dehydrogenase (quinone)  37.38 
 
 
247 aa  58.5  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0846324  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0751  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  34.34 
 
 
165 aa  58.2  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0803861  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1100  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  29.76 
 
 
201 aa  57.8  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1070  NADH dehydrogenase subunit J  30.46 
 
 
218 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0756  NADH dehydrogenase subunit J  28.07 
 
 
200 aa  57.8  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.107327  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1577  NADH dehydrogenase subunit J  30.91 
 
 
207 aa  57.8  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.14601  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1691  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  42.31 
 
 
234 aa  57.4  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5535  NADH dehydrogenase subunit J  29.41 
 
 
174 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0371244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4490  NADH dehydrogenase subunit J  32.47 
 
 
236 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.246427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3817  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  31.93 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.214735  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5415  NADH dehydrogenase subunit J  28.76 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5092  NADH dehydrogenase subunit J  29.41 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2278  NADH dehydrogenase subunit J  28.9 
 
 
216 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.425688  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1520  NADH dehydrogenase subunit J  31.14 
 
 
177 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152196  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1876  NADH dehydrogenase subunit J  32.26 
 
 
241 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5470  NADH dehydrogenase subunit J  29.19 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5419  NADH dehydrogenase subunit J  29.19 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5144  NADH dehydrogenase subunit J  29.19 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4976  NADH dehydrogenase subunit J  29.19 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4994  NADH dehydrogenase subunit J  29.19 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5385  NADH dehydrogenase subunit J  29.19 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.82495e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5536  NADH dehydrogenase subunit J  29.19 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2157  NADH dehydrogenase subunit J  28.9 
 
 
216 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3124  NADH dehydrogenase (quinone)  36.17 
 
 
203 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0190  NADH dehydrogenase subunit J  33.72 
 
 
175 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03250  NADH dehydrogenase subunit J  32.89 
 
 
304 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1412  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain J  28.74 
 
 
215 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0333706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3745  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  28.4 
 
 
170 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.881448  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1808  NADH dehydrogenase subunit J  33.54 
 
 
181 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6673  NADH dehydrogenase subunit J  27.63 
 
 
277 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1568  NADH dehydrogenase subunit J  33.54 
 
 
181 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.788173  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1462  NADH dehydrogenase subunit J  33.54 
 
 
181 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2234  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  35 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124502  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>