More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0983 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0983  NADH dehydrogenase subunit J  100 
 
 
293 aa  584  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03250  NADH dehydrogenase subunit J  56.67 
 
 
304 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6673  NADH dehydrogenase subunit J  60.4 
 
 
277 aa  258  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4454  NADH dehydrogenase subunit J  58.92 
 
 
256 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.821732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1283  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  57.96 
 
 
256 aa  249  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.603625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4549  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  54.27 
 
 
273 aa  247  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4056  NADH dehydrogenase subunit J  57.68 
 
 
256 aa  247  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.814675  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7682  NADH dehydrogenase subunit J  46.64 
 
 
287 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0593  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 6 (chain J)-like protein  49.57 
 
 
270 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0393  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  51.56 
 
 
269 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1541  NADH dehydrogenase subunit J  46.3 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.582021  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1571  NADH dehydrogenase subunit J  46.3 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1595  NADH dehydrogenase subunit J  46.3 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0547  NADH dehydrogenase subunit J  53.36 
 
 
267 aa  192  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.424646  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0290  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase subunit 6  46.52 
 
 
296 aa  193  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.980992  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1876  NADH dehydrogenase subunit J  50.43 
 
 
241 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13175  NADH dehydrogenase subunit J  50 
 
 
262 aa  190  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3177  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  47.84 
 
 
256 aa  189  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4490  NADH dehydrogenase subunit J  48.66 
 
 
236 aa  182  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.246427 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0276  NADH dehydrogenase subunit J  46.15 
 
 
275 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6085  NADH dehydrogenase subunit J  49.78 
 
 
323 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302185  normal  0.0550219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4409  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  46.56 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0529  NADH dehydrogenase subunit J  50.22 
 
 
275 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3220  NADH dehydrogenase subunit J  40.52 
 
 
286 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0478  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  45.5 
 
 
301 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.373412  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2707  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  42.59 
 
 
325 aa  159  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5062  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  45.08 
 
 
349 aa  159  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0548  NADH dehydrogenase subunit J  42.31 
 
 
282 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07470  NADH dehydrogenase subunit J  43.83 
 
 
290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2686  NADH dehydrogenase subunit J  42.15 
 
 
286 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.163309  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1300  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  32.84 
 
 
203 aa  97.4  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0304857  normal  0.742134 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3215  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  40.22 
 
 
174 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4079  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  38.01 
 
 
172 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965894  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1040  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  40 
 
 
168 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0930  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  36.07 
 
 
216 aa  90.5  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3386  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  40.98 
 
 
170 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.836495  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2822  NADH dehydrogenase subunit J  32.86 
 
 
218 aa  89.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0418529  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2410  NADH dehydrogenase subunit J  33.33 
 
 
199 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1237  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  33.73 
 
 
179 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1345  NADH dehydrogenase subunit J  34.69 
 
 
201 aa  87.8  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0918  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  41.32 
 
 
197 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1608  NADH dehydrogenase (ubiquinone), J subunit  31.55 
 
 
201 aa  87  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0555  NADH-quinone oxidoreductase chain J  31.55 
 
 
201 aa  87  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2157  NADH dehydrogenase subunit J  31.61 
 
 
216 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5092  NADH dehydrogenase subunit J  34.62 
 
 
174 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1308  NADH dehydrogenase subunit J  30 
 
 
218 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1299  NADH dehydrogenase subunit J  30 
 
 
218 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1820  NADH dehydrogenase subunit J  30 
 
 
218 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0422  NADH dehydrogenase subunit J  30 
 
 
218 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1444  NADH dehydrogenase subunit J  30 
 
 
218 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0728  NADH dehydrogenase subunit J  30 
 
 
218 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51537  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0278  NADH dehydrogenase subunit J  32.82 
 
 
221 aa  86.7  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.960759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1139  NADH dehydrogenase subunit J  30 
 
 
218 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.352541  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0249  NADH dehydrogenase subunit J  32.82 
 
 
221 aa  86.7  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5107  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  35.85 
 
 
184 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2278  NADH dehydrogenase subunit J  31.09 
 
 
216 aa  85.5  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.425688  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3205  NADH dehydrogenase subunit J  29.56 
 
 
229 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00105562  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0400  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase subunit 6  33.15 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2716  NADH dehydrogenase subunit J  32.02 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307115 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1955  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  33.17 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.230241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2234  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  39.51 
 
 
169 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124502  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5144  NADH dehydrogenase subunit J  34.07 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4976  NADH dehydrogenase subunit J  34.07 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4994  NADH dehydrogenase subunit J  34.07 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5385  NADH dehydrogenase subunit J  34.07 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.82495e-17 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2040  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  33.92 
 
 
172 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000947304  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0717  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  32.31 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5536  NADH dehydrogenase subunit J  34.07 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3813  NADH dehydrogenase subunit J  35.03 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3337  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  31.31 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.30881  normal  0.29012 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5419  NADH dehydrogenase subunit J  33.51 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1037  NADH dehydrogenase subunit J  31.25 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.307574  normal  0.37068 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5470  NADH dehydrogenase subunit J  33.51 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5568  NADH dehydrogenase subunit J  30.05 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2291  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  31.07 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1031  NADH dehydrogenase subunit J  32.45 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.37217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5535  NADH dehydrogenase subunit J  32.97 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0371244 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5415  NADH dehydrogenase subunit J  33.51 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1070  NADH dehydrogenase subunit J  30.41 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1628  NADH dehydrogenase subunit J  30.05 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283353  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2264  NADH dehydrogenase subunit J  30.05 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95038  normal  0.114346 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2240  NADH dehydrogenase subunit J  30.05 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204099  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1510  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  28.72 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00574767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1307  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  38.69 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1577  NADH dehydrogenase subunit J  30.64 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.14601  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2205  NADH dehydrogenase subunit J  28.92 
 
 
210 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1525  NADH dehydrogenase subunit J  32.49 
 
 
200 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0995  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  31.77 
 
 
197 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1882  NADH dehydrogenase subunit J  28.92 
 
 
210 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.633846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2994  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  33.01 
 
 
203 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2053  NADH dehydrogenase subunit J  30.5 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0936  NADH dehydrogenase subunit J  29.91 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0874597  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0970  NADH dehydrogenase subunit J  29.25 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2823  NADH dehydrogenase subunit J  30.05 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869313  normal  0.0684756 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0160  NADH dehydrogenase subunit J  29.15 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02311  NADH dehydrogenase subunit J  31.98 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0965  NADH dehydrogenase I, J subunit  30.81 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0879  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  30.17 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000440797  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1756  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  30.21 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0282  NADH dehydrogenase subunit J  34.52 
 
 
200 aa  79  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>