257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10493 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10493  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  509  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1231  Integral membrane protein TerC  35.14 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6503  Integral membrane protein TerC  32.42 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  30 
 
 		 247 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  30.31 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1627  Integral membrane protein TerC  36.36 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.189416 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3736  TerC family membrane protein  33.33 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  29.64 
 
 		 250 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  33.02 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  33.01 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0242  integral membrane protein TerC  33.98 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0423547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  30.16 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  29.39 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  33.49 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  33.33 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2953  Integral membrane protein TerC  30.16 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000321183  unclonable  0.0000000329078 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  33.33 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  29.96 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  34.31 
 
 		 259 aa  108  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  29.6 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  29.92 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  29.53 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  30.95 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  31.62 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  29.48 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  31.51 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  29.12 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2045  integral membrane protein TerC  34.27 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7344  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  29.8 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  28.1 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  31 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  31.76 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  28.29 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  28.93 
 
 		 518 aa  105  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2157  Integral membrane protein TerC  29.44 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  29.34 
 
 		 518 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  29.17 
 
 		 519 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  29.34 
 
 		 518 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  29.34 
 
 		 518 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  29.34 
 
 		 518 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3716  Integral membrane protein TerC  32.51 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  29.34 
 
 		 518 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  29.34 
 
 		 518 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  29.34 
 
 		 518 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  29.34 
 
 		 518 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  26.44 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  29.17 
 
 		 519 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  29.17 
 
 		 519 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  29.17 
 
 		 519 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  29.34 
 
 		 516 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  29.17 
 
 		 519 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  26.44 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  26.05 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06210  tellurium resistance membrane protein TerC  26.48 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.230704  hitchhiker  0.00150346 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  30.96 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  30.39 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1736  Integral membrane protein TerC  27.49 
 
 		 369 aa  102  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.146696  normal  0.0106788 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  33.8 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  30.2 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  28.85 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  28.85 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1505  integral membrane protein TerC  30.74 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0874873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  31.28 
 
 		 514 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1135  TerC family membrane protein  33.61 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560446  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  29.02 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0537  integral membrane protein TerC  31.16 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2908  inner membrane protein  33.61 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241578  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2752  TerC family membrane protein  33.61 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2691  membrane protein, TerC family  31.56 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607869  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  30.62 
 
 		 510 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  29.15 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  30.33 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  27.2 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  30.39 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5520  integral membrane protein TerC  30.13 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350667  normal  0.0618236 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1139  integral membrane protein TerC  31.93 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  29.58 
 
 		 250 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4909  Integral membrane protein TerC  28.34 
 
 		 250 aa  99.4  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  29.32 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1664  hypothetical protein  32.49 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.898463  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1721  hypothetical protein  32.49 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  27.89 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1151  integral membrane protein TerC  31.51 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.337548 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  29.46 
 
 		 527 aa  99  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003577  hypothetical protein  31.06 
 
 		 256 aa  98.6  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  30.49 
 
 		 295 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  30.48 
 
 		 518 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  29.54 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  34.47 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  29.76 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  31.09 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  31.09 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1196  integral membrane protein TerC  33.49 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349001  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02536  hypothetical protein  30.34 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  27.47 
 
 		 529 aa  97.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  30.73 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1232  integral membrane protein TerC  31.09 
 
 		 251 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  0.537044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4147  hypothetical protein  30.59 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.976198  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  30.31 
 
 		 252 aa  95.5  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  31.28 
 
 		 256 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>