More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2157 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2157  Integral membrane protein TerC  100 
 
 
295 aa  577  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.6 
 
 
519 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  48.6 
 
 
519 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.6 
 
 
519 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  55.47 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  48.6 
 
 
519 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  48.91 
 
 
518 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  48.91 
 
 
518 aa  253  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.91 
 
 
516 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  48.91 
 
 
518 aa  253  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  48.91 
 
 
518 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  48.91 
 
 
518 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.91 
 
 
518 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  48.91 
 
 
518 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  48.91 
 
 
518 aa  253  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.19 
 
 
519 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  52.03 
 
 
518 aa  251  8.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  47.77 
 
 
518 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  54.58 
 
 
253 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  52.23 
 
 
250 aa  248  7e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  50.2 
 
 
510 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  51.22 
 
 
514 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  52.36 
 
 
259 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  56.4 
 
 
255 aa  246  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  54.03 
 
 
250 aa  245  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  53.2 
 
 
252 aa  244  9e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  54.73 
 
 
250 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  49.59 
 
 
522 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  50.61 
 
 
523 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0193  TerC family transport protein  48.61 
 
 
518 aa  242  6e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.026546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  50.61 
 
 
523 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  50.61 
 
 
523 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  51.02 
 
 
518 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  43.53 
 
 
522 aa  241  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  50.61 
 
 
523 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  51.84 
 
 
248 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  48.77 
 
 
522 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  49.59 
 
 
518 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  55.02 
 
 
248 aa  238  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  52.36 
 
 
249 aa  237  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1852  integral membrane protein TerC  50.2 
 
 
522 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1927  Integral membrane protein TerC  51.22 
 
 
518 aa  236  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  46.74 
 
 
530 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  52.16 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  48.55 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  54.55 
 
 
268 aa  232  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1650  CBS domain-containing protein  49.4 
 
 
522 aa  232  6e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  53.69 
 
 
257 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  56.77 
 
 
245 aa  231  9e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  54.25 
 
 
253 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11570  Integral membrane protein, TerC family  50.2 
 
 
518 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  54.25 
 
 
253 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  52.82 
 
 
250 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  54.25 
 
 
253 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2463  integral membrane protein TerC  49.2 
 
 
514 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2367  CBS domain-containing protein  49.2 
 
 
514 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  48 
 
 
577 aa  229  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2953  Integral membrane protein TerC  54.96 
 
 
258 aa  229  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000321183  unclonable  0.0000000329078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4056  hypothetical protein  50 
 
 
515 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47040  TerC family protein  50 
 
 
515 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53321  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  46.77 
 
 
254 aa  228  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2020  Integral membrane protein TerC  49.59 
 
 
517 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  50.96 
 
 
264 aa  225  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  46.96 
 
 
528 aa  225  8e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  52.54 
 
 
259 aa  225  8e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  48.68 
 
 
253 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1984  Integral membrane protein TerC  50 
 
 
517 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  45.95 
 
 
253 aa  223  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  48.58 
 
 
527 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  54.39 
 
 
253 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  51.29 
 
 
238 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  51.22 
 
 
247 aa  223  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4909  Integral membrane protein TerC  51.69 
 
 
250 aa  222  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240908  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2450  CBS domain-containing protein  51.07 
 
 
528 aa  222  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.889017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  50.43 
 
 
238 aa  222  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3192  CBS domain-containing protein  50.64 
 
 
528 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.237895  hitchhiker  0.00326333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1580  integral membrane protein TerC  51.22 
 
 
528 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.424407  normal  0.735145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  55.06 
 
 
244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2549  integral membrane protein TerC  50.64 
 
 
528 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.584861  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  50.2 
 
 
251 aa  219  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  46.72 
 
 
529 aa  219  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  45.9 
 
 
249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  48.32 
 
 
242 aa  218  7e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  47.46 
 
 
241 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  52.07 
 
 
241 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1627  Integral membrane protein TerC  47.69 
 
 
256 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.189416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  44.84 
 
 
250 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  44.84 
 
 
250 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  44.58 
 
 
250 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2106  hypothetical protein  50.58 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  45.16 
 
 
250 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1664  hypothetical protein  50.64 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.898463  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  44.67 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  52.59 
 
 
238 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0787  integral membrane protein TerC  52.57 
 
 
256 aa  213  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  50.22 
 
 
250 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  47.84 
 
 
271 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2870  integral membrane protein TerC  51.43 
 
 
522 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  47.23 
 
 
246 aa  212  5.999999999999999e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  46.89 
 
 
252 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>