More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1505 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1505  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 241 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0874873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2045  integral membrane protein TerC  84.85 
 
 		 241 aa  381  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7344  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2948  Integral membrane protein TerC  80.25 
 
 		 240 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4147  hypothetical protein  78.57 
 
 		 241 aa  350  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.976198  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2631  integral membrane protein TerC  77.41 
 
 		 240 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.124087  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  63.68 
 
 		 253 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  55.65 
 
 		 239 aa  265  5e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  51.71 
 
 		 518 aa  259  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  53.75 
 
 		 259 aa  259  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.71 
 
 		 519 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.71 
 
 		 519 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.71 
 
 		 519 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  51.71 
 
 		 519 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  51.71 
 
 		 519 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  51.25 
 
 		 238 aa  258  7e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  55.37 
 
 		 252 aa  258  8e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  54.58 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50.43 
 
 		 516 aa  256  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  50.43 
 
 		 518 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  50.43 
 
 		 518 aa  256  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50.43 
 
 		 518 aa  256  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50.43 
 
 		 518 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  50.43 
 
 		 518 aa  256  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50.43 
 
 		 518 aa  256  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  50.43 
 
 		 518 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50.43 
 
 		 518 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  56.07 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  55.19 
 
 		 248 aa  254  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  54.55 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  52.5 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  57.26 
 
 		 250 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  52.28 
 
 		 241 aa  250  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  51.85 
 
 		 246 aa  251  1e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  58.08 
 
 		 245 aa  248  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  53.06 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  52.92 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  47.93 
 
 		 514 aa  245  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  51.91 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  53.16 
 
 		 253 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  53.72 
 
 		 259 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  52.52 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  51.05 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  48.96 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  54.36 
 
 		 253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  48.55 
 
 		 250 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  48.55 
 
 		 250 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  56.79 
 
 		 257 aa  242  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  57.08 
 
 		 250 aa  241  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  54.22 
 
 		 264 aa  241  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  49.79 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  48.75 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  48.55 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  48.56 
 
 		 249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  49.17 
 
 		 247 aa  238  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  54.43 
 
 		 255 aa  238  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  47.26 
 
 		 518 aa  238  8e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  48.54 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1650  CBS domain-containing protein  51.28 
 
 		 522 aa  236  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  51.23 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2463  integral membrane protein TerC  51.28 
 
 		 514 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2367  CBS domain-containing protein  51.28 
 
 		 514 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  56.85 
 
 		 249 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  56.41 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  54.55 
 
 		 241 aa  234  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  47.26 
 
 		 528 aa  234  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  46.47 
 
 		 510 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  49.15 
 
 		 530 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  49.79 
 
 		 243 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2490  Integral membrane protein TerC  55 
 
 		 251 aa  232  5e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  48.35 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  46.84 
 
 		 577 aa  229  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1984  Integral membrane protein TerC  48.72 
 
 		 517 aa  228  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  48.12 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  47.33 
 
 		 251 aa  228  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1664  hypothetical protein  51.69 
 
 		 247 aa  228  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.898463  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1721  hypothetical protein  51.69 
 
 		 247 aa  228  7e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  53.14 
 
 		 245 aa  228  8e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  55.08 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0193  TerC family transport protein  45.8 
 
 		 518 aa  227  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.026546 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  48.32 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2160  integral membrane protein TerC  54.58 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  45.38 
 
 		 523 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  49.17 
 
 		 251 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  45.38 
 
 		 523 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1927  Integral membrane protein TerC  46.84 
 
 		 518 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  49.17 
 
 		 251 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  45.38 
 
 		 523 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  46.84 
 
 		 518 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  45.9 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  51.9 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  51.9 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  51.48 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  45.57 
 
 		 527 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3194  integral membrane protein TerC  49.58 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  51.9 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4355  Integral membrane protein TerC  49.79 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  46.41 
 
 		 522 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  45.61 
 
 		 523 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3716  Integral membrane protein TerC  46.94 
 
 		 251 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  45.57 
 
 		 529 aa  221  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>