More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3874 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 253 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1505  integral membrane protein TerC  62.96 
 
 		 241 aa  279  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0874873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4147  hypothetical protein  61.73 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.976198  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2045  integral membrane protein TerC  59.83 
 
 		 241 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7344  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  52.46 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  55.6 
 
 		 248 aa  262  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2948  Integral membrane protein TerC  57.85 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  55.83 
 
 		 259 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  50.8 
 
 		 248 aa  258  9e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1664  hypothetical protein  55.37 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.898463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  52.59 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1721  hypothetical protein  55.37 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  51.61 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  52.67 
 
 		 251 aa  255  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  52.07 
 
 		 247 aa  254  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  50.61 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  50.61 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  50.61 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  51.03 
 
 		 250 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  50.83 
 
 		 239 aa  253  3e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2631  integral membrane protein TerC  58.26 
 
 		 240 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.124087  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  51.82 
 
 		 254 aa  251  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  48.97 
 
 		 249 aa  250  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  50.4 
 
 		 250 aa  250  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3716  Integral membrane protein TerC  52.05 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  52.38 
 
 		 250 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  52.05 
 
 		 253 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  48.56 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  48.15 
 
 		 523 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  48.57 
 
 		 528 aa  248  9e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  48.15 
 
 		 523 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  58.8 
 
 		 253 aa  248  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  48.15 
 
 		 523 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  56.2 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  53.97 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  49.38 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  49.39 
 
 		 529 aa  246  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  48.98 
 
 		 577 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  49.39 
 
 		 529 aa  245  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3194  integral membrane protein TerC  53.88 
 
 		 255 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  52.23 
 
 		 253 aa  245  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  47.83 
 
 		 252 aa  245  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  48.41 
 
 		 527 aa  243  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  52.82 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  53.59 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  48.13 
 
 		 518 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  47.33 
 
 		 523 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  47.43 
 
 		 518 aa  242  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11570  Integral membrane protein, TerC family  48.79 
 
 		 518 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  48.41 
 
 		 255 aa  241  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  49.17 
 
 		 242 aa  241  7e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  50.41 
 
 		 241 aa  241  9e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  46.88 
 
 		 522 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  47.04 
 
 		 522 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  50.21 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  47.72 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1580  integral membrane protein TerC  52.28 
 
 		 528 aa  239  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.424407  normal  0.735145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  48.78 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  46.61 
 
 		 518 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  46.48 
 
 		 522 aa  238  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1196  integral membrane protein TerC  55.79 
 
 		 248 aa  238  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  47.93 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  47.54 
 
 		 238 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  50.42 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  50.42 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  46 
 
 		 510 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3736  TerC family membrane protein  46.5 
 
 		 261 aa  236  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  47.04 
 
 		 518 aa  235  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  51.07 
 
 		 251 aa  235  6e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  44.84 
 
 		 250 aa  234  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  53.94 
 
 		 245 aa  234  9e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  46.34 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  53.36 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  47.58 
 
 		 518 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  47.58 
 
 		 518 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  47.58 
 
 		 518 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  47.58 
 
 		 516 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  53.07 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  47.58 
 
 		 518 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  47.41 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  47.58 
 
 		 518 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  47.58 
 
 		 518 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  47.58 
 
 		 518 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  47.58 
 
 		 518 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5520  integral membrane protein TerC  50.85 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350667  normal  0.0618236 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01969  fused predicted membrane protein/predicted membrane protein  47.62 
 
 		 527 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1594  Integral membrane protein TerC  47.62 
 
 		 527 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2998  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  47.62 
 
 		 527 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.159646 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01958  hypothetical protein  47.62 
 
 		 527 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2356  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  47.62 
 
 		 527 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1578  integral membrane protein TerC  47.62 
 
 		 527 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1169  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  47.62 
 
 		 527 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47040  TerC family protein  48.96 
 
 		 515 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53321  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1232  integral membrane protein TerC  51.75 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  0.537044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0999  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  47.62 
 
 		 527 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  47.98 
 
 		 519 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  47.98 
 
 		 519 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  47.98 
 
 		 519 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1852  integral membrane protein TerC  47.04 
 
 		 522 aa  232  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>