More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3736 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3736  TerC family membrane protein  100 
 
 
261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407676  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  50.21 
 
 
250 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  49.79 
 
 
250 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  49.79 
 
 
250 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  49.37 
 
 
250 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  51.52 
 
 
247 aa  241  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  51.9 
 
 
238 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  50.21 
 
 
249 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  44.4 
 
 
518 aa  235  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  46.74 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  44.7 
 
 
514 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0242  integral membrane protein TerC  50.41 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0423547  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  45 
 
 
242 aa  231  7.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  50.86 
 
 
243 aa  230  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  49.12 
 
 
250 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.5 
 
 
519 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  48.5 
 
 
519 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  46.46 
 
 
253 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  48.5 
 
 
519 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.5 
 
 
519 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.5 
 
 
519 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  46.37 
 
 
252 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  48.73 
 
 
238 aa  228  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  50 
 
 
252 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  47.64 
 
 
253 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  49.36 
 
 
510 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  47.3 
 
 
248 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  47.64 
 
 
516 aa  226  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  47.64 
 
 
518 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  47.64 
 
 
518 aa  226  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  47.64 
 
 
518 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  48.09 
 
 
241 aa  226  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  47.64 
 
 
518 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  47.64 
 
 
518 aa  226  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  47.64 
 
 
518 aa  226  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  47.64 
 
 
518 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  47.64 
 
 
518 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  48.95 
 
 
239 aa  226  3e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  51.82 
 
 
255 aa  226  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3194  integral membrane protein TerC  51.03 
 
 
255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  49.38 
 
 
254 aa  225  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  49.79 
 
 
238 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  47.97 
 
 
251 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  45.28 
 
 
249 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  51.9 
 
 
250 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  44.53 
 
 
518 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4355  Integral membrane protein TerC  50 
 
 
253 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  49.36 
 
 
271 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1721  hypothetical protein  52.12 
 
 
247 aa  222  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  42.29 
 
 
259 aa  222  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  48.18 
 
 
250 aa  222  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1664  hypothetical protein  52.12 
 
 
247 aa  222  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.898463  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  48.26 
 
 
241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4672  integral membrane protein TerC  51.34 
 
 
250 aa  221  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  50.19 
 
 
264 aa  221  9e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  47.16 
 
 
522 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4909  Integral membrane protein TerC  52.56 
 
 
250 aa  220  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240908  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  45.49 
 
 
251 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  45.49 
 
 
251 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  47.11 
 
 
238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  50.4 
 
 
253 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  48.32 
 
 
257 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3716  Integral membrane protein TerC  51.69 
 
 
251 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  45.68 
 
 
250 aa  219  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  50.22 
 
 
253 aa  218  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  49.15 
 
 
249 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  46.69 
 
 
248 aa  218  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2953  Integral membrane protein TerC  47.08 
 
 
258 aa  218  7.999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000321183  unclonable  0.0000000329078 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  44.02 
 
 
518 aa  218  7.999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4147  hypothetical protein  45.9 
 
 
241 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.976198  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2691  membrane protein, TerC family  52 
 
 
253 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607869  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  44.54 
 
 
250 aa  216  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  45.87 
 
 
249 aa  217  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  49.37 
 
 
238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  50 
 
 
237 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  50 
 
 
237 aa  216  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000383082  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  50 
 
 
237 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  50 
 
 
237 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  50 
 
 
237 aa  216  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  50 
 
 
237 aa  216  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  50 
 
 
237 aa  216  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1139  integral membrane protein TerC  47.01 
 
 
267 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  44.94 
 
 
268 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  46.15 
 
 
254 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  50 
 
 
237 aa  216  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  44.27 
 
 
256 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  48.96 
 
 
251 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  50 
 
 
237 aa  216  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130968  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  46.29 
 
 
522 aa  215  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1627  Integral membrane protein TerC  49 
 
 
256 aa  215  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.189416 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2020  Integral membrane protein TerC  43.02 
 
 
517 aa  215  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1232  integral membrane protein TerC  47.3 
 
 
251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  0.537044 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  43.59 
 
 
522 aa  215  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  44.27 
 
 
256 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1151  integral membrane protein TerC  46.58 
 
 
251 aa  214  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.337548 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2463  integral membrane protein TerC  45.35 
 
 
514 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1650  CBS domain-containing protein  45.35 
 
 
522 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2367  CBS domain-containing protein  45.35 
 
 
514 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  49.34 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  43.51 
 
 
523 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>