More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0537 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0537  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 259 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  64.61 
 
 		 243 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  62.5 
 
 		 254 aa  299  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  62.13 
 
 		 249 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  61 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  59.5 
 
 		 250 aa  295  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  59.5 
 
 		 250 aa  295  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  59.09 
 
 		 250 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  59.5 
 
 		 250 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_004310  BR1721  hypothetical protein  60.67 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1664  hypothetical protein  60.25 
 
 		 247 aa  281  8.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.898463  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3194  integral membrane protein TerC  57.2 
 
 		 255 aa  280  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  61.25 
 
 		 251 aa  280  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  58.54 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3716  Integral membrane protein TerC  60.85 
 
 		 251 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  57.14 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  57.14 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  55.92 
 
 		 252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  56.91 
 
 		 249 aa  270  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0242  integral membrane protein TerC  61.02 
 
 		 258 aa  268  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0423547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  58.47 
 
 		 271 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4403  integral membrane protein TerC  56.47 
 
 		 263 aa  268  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1566  integral membrane protein TerC  58.85 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.22924 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1196  integral membrane protein TerC  59.83 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349001  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5520  integral membrane protein TerC  58.47 
 
 		 274 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350667  normal  0.0618236 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1232  integral membrane protein TerC  57.63 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  0.537044 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1760  hypothetical protein  62.27 
 
 		 244 aa  265  5.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1139  integral membrane protein TerC  56.05 
 
 		 267 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1151  integral membrane protein TerC  56.78 
 
 		 251 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.337548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1673  Integral membrane protein TerC  59.83 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4355  Integral membrane protein TerC  58.13 
 
 		 253 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2908  inner membrane protein  59.57 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241578  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2752  TerC family membrane protein  59.57 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1135  TerC family membrane protein  59.57 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560446  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2691  membrane protein, TerC family  56.78 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607869  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4672  integral membrane protein TerC  58.77 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0807  hypothetical protein  56.1 
 
 		 250 aa  254  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1845  Integral membrane protein TerC  58.97 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4488  Integral membrane protein TerC  56.33 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2551  integral membrane protein TerC  60.37 
 
 		 257 aa  251  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2902  integral membrane protein TerC  59.32 
 
 		 246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.807584  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  49.78 
 
 		 518 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4110  integral membrane protein TerC  60.53 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50.86 
 
 		 519 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50.86 
 
 		 519 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  50.86 
 
 		 519 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50.86 
 
 		 519 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  50.86 
 
 		 519 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  49.35 
 
 		 522 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  50.87 
 
 		 518 aa  239  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  50 
 
 		 518 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 518 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50 
 
 		 516 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50 
 
 		 518 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 518 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50 
 
 		 518 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  50 
 
 		 518 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50 
 
 		 518 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50 
 
 		 518 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4942  Integral membrane protein TerC  60.09 
 
 		 252 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 528 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  48.31 
 
 		 522 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  49.35 
 
 		 523 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1852  integral membrane protein TerC  50.65 
 
 		 522 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 577 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  50.43 
 
 		 518 aa  231  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  50.43 
 
 		 529 aa  231  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  47.88 
 
 		 522 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  47.37 
 
 		 249 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 514 aa  229  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  48.48 
 
 		 523 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  50.43 
 
 		 527 aa  230  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  48.48 
 
 		 523 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  48.48 
 
 		 523 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 529 aa  228  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  49.36 
 
 		 510 aa  228  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  48.91 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  48.07 
 
 		 518 aa  225  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  47.28 
 
 		 249 aa  224  7e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  48.47 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4056  hypothetical protein  49.78 
 
 		 515 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  52.81 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  45.92 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3736  TerC family membrane protein  45.45 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3379  integral membrane protein TerC  50.89 
 
 		 530 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11570  Integral membrane protein, TerC family  50.21 
 
 		 518 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  47.64 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2631  integral membrane protein TerC  49.79 
 
 		 240 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.124087  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47040  TerC family protein  48.5 
 
 		 515 aa  221  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53321  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  49.35 
 
 		 253 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  47.39 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4147  hypothetical protein  50.21 
 
 		 241 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.976198  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2045  integral membrane protein TerC  48.44 
 
 		 241 aa  219  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7344  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0193  TerC family transport protein  46.35 
 
 		 518 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.026546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2948  Integral membrane protein TerC  48.29 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  48.71 
 
 		 255 aa  218  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1505  integral membrane protein TerC  48.92 
 
 		 241 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0874873 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  48.48 
 
 		 242 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3192  CBS domain-containing protein  48.71 
 
 		 528 aa  218  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.237895  hitchhiker  0.00326333 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2549  integral membrane protein TerC  48.71 
 
 		 528 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.584861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>