More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1627 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1627  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 256 aa  504  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.189416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  54.51 
 
 		 250 aa  255  6e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  53.36 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  51.22 
 
 		 253 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  50.21 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  53.75 
 
 		 248 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2953  Integral membrane protein TerC  54.4 
 
 		 258 aa  241  7.999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000321183  unclonable  0.0000000329078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  51.32 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  49.02 
 
 		 259 aa  239  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  52.03 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  53.88 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  50.79 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 253 aa  235  7e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  55.79 
 
 		 255 aa  234  8e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  51.76 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  49.37 
 
 		 251 aa  231  8.000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  53.71 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  52.85 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  51.68 
 
 		 256 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  49.36 
 
 		 241 aa  228  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  54.77 
 
 		 244 aa  228  7e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  50.21 
 
 		 255 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  52.32 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  50.82 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  50.82 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  52.4 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3736  TerC family membrane protein  50.85 
 
 		 261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  50.61 
 
 		 250 aa  224  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.66 
 
 		 519 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.66 
 
 		 519 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.66 
 
 		 519 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  48.62 
 
 		 518 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  48.66 
 
 		 519 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  48.66 
 
 		 519 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  50.58 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  47.77 
 
 		 510 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  48.66 
 
 		 518 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  50.22 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  48.66 
 
 		 518 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  46.49 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  48.66 
 
 		 518 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  48.07 
 
 		 518 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  48.66 
 
 		 518 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  51.44 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  48.66 
 
 		 518 aa  223  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  46.49 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  48.66 
 
 		 518 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.66 
 
 		 518 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  48.9 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  48.66 
 
 		 518 aa  223  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.66 
 
 		 516 aa  222  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  46.05 
 
 		 250 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  46.22 
 
 		 250 aa  221  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  48.62 
 
 		 523 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  48.62 
 
 		 523 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  48.17 
 
 		 523 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  52.63 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  47.64 
 
 		 522 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  48.23 
 
 		 243 aa  219  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  46.88 
 
 		 518 aa  218  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  48.05 
 
 		 247 aa  218  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  53.1 
 
 		 238 aa  218  7e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  45.61 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  48.17 
 
 		 523 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  49.58 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  48.66 
 
 		 514 aa  216  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  46.38 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  48.03 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  51.08 
 
 		 239 aa  216  4e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  50.41 
 
 		 253 aa  215  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4672  integral membrane protein TerC  52.31 
 
 		 250 aa  215  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  50.83 
 
 		 245 aa  215  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  49.14 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  49.78 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3194  integral membrane protein TerC  48.12 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  48.2 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  49.59 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2157  Integral membrane protein TerC  49.59 
 
 		 295 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  45.58 
 
 		 522 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  50.87 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  47.01 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  46.89 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69320  putative integral membrane transport protein  51.45 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  46.3 
 
 		 528 aa  211  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5995  hypothetical protein  51.45 
 
 		 252 aa  211  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  45.96 
 
 		 251 aa  211  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  47.22 
 
 		 529 aa  211  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  49.14 
 
 		 251 aa  211  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  46.88 
 
 		 518 aa  211  9e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1664  hypothetical protein  48.91 
 
 		 247 aa  210  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.898463  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  46.76 
 
 		 527 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72180  putative membrane protein TerC  50.83 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.559812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1231  Integral membrane protein TerC  44.61 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  45.41 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1852  integral membrane protein TerC  46.61 
 
 		 522 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  46.7 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  47.84 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0787  integral membrane protein TerC  51.21 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  45.83 
 
 		 577 aa  209  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>