43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5253 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5253  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  157  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0436617 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1279  hypothetical protein  84.42 
 
 		 92 aa  140  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157817  normal  0.180796 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5455  hypothetical protein  46.67 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632122 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6459  hypothetical protein  45 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.624579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1370  hypothetical protein  45 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0344819  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6051  hypothetical protein  43.33 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0458725 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5637  hypothetical protein  43.75 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.364961  normal  0.0737283 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6385  hypothetical protein  42.19 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344963  normal  0.609556 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3153  hypothetical protein  41.67 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515124  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1974  hypothetical protein  41.67 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1282  hypothetical protein  41.67 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37064  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0994  hypothetical protein  41.67 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847178  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1373  hypothetical protein  41.67 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3024  hypothetical protein  41.67 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0862773  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1780  hypothetical protein  45 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4912  hypothetical protein  41.79 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4768  hypothetical protein  42.59 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.611837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3607  hypothetical protein  43.86 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2014  hypothetical protein  36.21 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3400  hypothetical protein  41.67 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00844504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3285  hypothetical protein  40.28 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2095  hypothetical protein  34.48 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2094  hypothetical protein  34.48 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0951  hypothetical protein  35 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5166  hypothetical protein  34.48 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000077985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2993  hypothetical protein  35 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948652  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1261  hypothetical protein  36.07 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2286  hypothetical protein  36.07 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1972  hypothetical protein  32.79 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192327  normal  0.0363609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1064  hypothetical protein  39.29 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1255  hypothetical protein  33.93 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44400  hypothetical protein  31.75 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2556  hypothetical protein  32.76 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0257422  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  35.09 
 
 		 526 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4044  hypothetical protein  29.09 
 
 		 63 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345099  normal  0.110238 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16880  hypothetical protein  32.76 
 
 		 61 aa  43.5  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.301731  normal  0.232063 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1083  hypothetical protein  33.9 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3095  hypothetical protein  29.51 
 
 		 82 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00697991  hitchhiker  0.00154018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6514  hypothetical protein  35.09 
 
 		 82 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3667  hypothetical protein  30.19 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3211  hypothetical protein  29.51 
 
 		 99 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.47234  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1055  hypothetical protein  41.3 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000280368  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  35.09 
 
 		 399 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>