52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2094 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2094  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2095  hypothetical protein  96.77 
 
 
62 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2014  hypothetical protein  44.07 
 
 
63 aa  67  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6385  hypothetical protein  44.64 
 
 
99 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344963  normal  0.609556 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5637  hypothetical protein  44.64 
 
 
99 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.364961  normal  0.0737283 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5455  hypothetical protein  46.43 
 
 
99 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632122 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6459  hypothetical protein  44.64 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.624579  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1370  hypothetical protein  44.64 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0344819  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6051  hypothetical protein  42.86 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0458725 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0068  hypothetical protein  42.62 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.550883  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1780  hypothetical protein  44.64 
 
 
64 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1974  hypothetical protein  41.07 
 
 
78 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1282  hypothetical protein  41.07 
 
 
78 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37064  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0994  hypothetical protein  41.07 
 
 
78 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847178  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1373  hypothetical protein  41.07 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3024  hypothetical protein  41.07 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0862773  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3153  hypothetical protein  41.07 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3400  hypothetical protein  46.43 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00844504  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0951  hypothetical protein  46.43 
 
 
64 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4912  hypothetical protein  41.07 
 
 
77 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1279  hypothetical protein  39.66 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157817  normal  0.180796 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1255  hypothetical protein  49.02 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2993  hypothetical protein  46.43 
 
 
73 aa  55.1  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948652  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5253  hypothetical protein  34.48 
 
 
77 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0436617 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3607  hypothetical protein  44.44 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1083  hypothetical protein  45.59 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3285  hypothetical protein  44.44 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  44.64 
 
 
399 aa  50.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4768  hypothetical protein  46.15 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.611837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1672  hypothetical protein  42.86 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2541  hypothetical protein  42.86 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000693132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3006  hypothetical protein  35.09 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863054  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3048  hypothetical protein  35.09 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.810584  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  41.07 
 
 
526 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2556  hypothetical protein  34.55 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0257422  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2881  hypothetical protein  36.07 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00637074  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1261  hypothetical protein  32.69 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388151  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16880  hypothetical protein  29.31 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.301731  normal  0.232063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1972  hypothetical protein  28.57 
 
 
76 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192327  normal  0.0363609 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5166  hypothetical protein  28.81 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000077985 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1064  hypothetical protein  33.9 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1453  hypothetical protein  39.22 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.297138  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3095  hypothetical protein  30.36 
 
 
82 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00697991  hitchhiker  0.00154018 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3211  hypothetical protein  30.36 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.47234  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6514  hypothetical protein  29.51 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3151  hypothetical protein  30.36 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213868  hitchhiker  0.0000000948825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2545  hypothetical protein  29.51 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0768609  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44400  hypothetical protein  30.36 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3159  hypothetical protein  29.51 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0975559  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3667  hypothetical protein  26.32 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3177  hypothetical protein  29.51 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0330701  hitchhiker  0.0000310225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3923  hypothetical protein  32 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119406  decreased coverage  0.00597108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>