39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1279 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1279  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  188  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157817  normal  0.180796 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5253  hypothetical protein  84.42 
 
 		 77 aa  140  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0436617 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5455  hypothetical protein  40.68 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632122 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3153  hypothetical protein  40.68 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3024  hypothetical protein  40.68 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0862773  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1974  hypothetical protein  40.68 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1373  hypothetical protein  40.68 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577002  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1370  hypothetical protein  40.68 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0344819  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1282  hypothetical protein  40.68 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37064  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6459  hypothetical protein  40.68 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.624579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0994  hypothetical protein  40.68 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847178  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6051  hypothetical protein  38.98 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0458725 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5637  hypothetical protein  38.1 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.364961  normal  0.0737283 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6385  hypothetical protein  38.1 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344963  normal  0.609556 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4912  hypothetical protein  40.3 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1780  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2095  hypothetical protein  39.66 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2094  hypothetical protein  39.66 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4768  hypothetical protein  38.6 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.611837 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2014  hypothetical protein  35.09 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3400  hypothetical protein  41.67 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00844504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3607  hypothetical protein  42.11 
 
 		 125 aa  50.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44400  hypothetical protein  40.35 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5166  hypothetical protein  33.33 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000077985 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3285  hypothetical protein  38.89 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0951  hypothetical protein  35 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  39.29 
 
 		 526 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2993  hypothetical protein  38.33 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948652  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1255  hypothetical protein  35.71 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4044  hypothetical protein  30.19 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345099  normal  0.110238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3667  hypothetical protein  31.48 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1064  hypothetical protein  37.5 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  41.38 
 
 		 399 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16880  hypothetical protein  32.76 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.301731  normal  0.232063 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3006  hypothetical protein  30 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863054  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3048  hypothetical protein  30 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.810584  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1055  hypothetical protein  45.45 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000280368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1358  hypothetical protein  36.73 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2556  hypothetical protein  31.03 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0257422  normal  0.732046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>