26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2556 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2556  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  156  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0257422  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2881  hypothetical protein  43.06 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00637074  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5455  hypothetical protein  38.18 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632122 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6385  hypothetical protein  36.21 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344963  normal  0.609556 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5637  hypothetical protein  36.21 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.364961  normal  0.0737283 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0068  hypothetical protein  38.89 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.550883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6051  hypothetical protein  34.55 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0458725 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1370  hypothetical protein  32.73 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0344819  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6459  hypothetical protein  32.73 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.624579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2094  hypothetical protein  34.55 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2095  hypothetical protein  34.55 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1360  hypothetical protein  37.93 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5253  hypothetical protein  32.76 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0436617 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1255  hypothetical protein  27.78 
 
 		 84 aa  43.9  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1780  hypothetical protein  25.86 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44400  hypothetical protein  33.9 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4912  hypothetical protein  32.73 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0994  hypothetical protein  31.03 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847178  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3024  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0862773  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3153  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515124  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1282  hypothetical protein  31.03 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37064  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1974  hypothetical protein  31.03 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1373  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577002  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  31.43 
 
 		 526 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1279  hypothetical protein  31.03 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157817  normal  0.180796 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3285  hypothetical protein  28.3 
 
 		 125 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>