39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1255 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1255  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  168  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  52.44 
 
 
526 aa  82  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  58.46 
 
 
399 aa  80.9  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2014  hypothetical protein  42.62 
 
 
63 aa  62  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1780  hypothetical protein  43.64 
 
 
64 aa  60.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1360  hypothetical protein  33.75 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2095  hypothetical protein  49.02 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2094  hypothetical protein  49.02 
 
 
62 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0951  hypothetical protein  41.07 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5166  hypothetical protein  37.7 
 
 
63 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000077985 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6385  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344963  normal  0.609556 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5637  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.364961  normal  0.0737283 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5455  hypothetical protein  36.36 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632122 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6051  hypothetical protein  34.67 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0458725 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1370  hypothetical protein  38.18 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0344819  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6459  hypothetical protein  38.18 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.624579  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44400  hypothetical protein  35.59 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3400  hypothetical protein  34.78 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00844504  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1279  hypothetical protein  35.71 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157817  normal  0.180796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1083  hypothetical protein  42.86 
 
 
133 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2993  hypothetical protein  38.6 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948652  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5253  hypothetical protein  33.93 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0436617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3667  hypothetical protein  27.27 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4912  hypothetical protein  39.22 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2565  hypothetical protein  30.36 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480813  normal  0.623984 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3024  hypothetical protein  32.73 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0862773  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1974  hypothetical protein  32.73 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3153  hypothetical protein  32.73 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515124  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1282  hypothetical protein  32.73 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37064  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0994  hypothetical protein  32.73 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847178  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1373  hypothetical protein  32.73 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1672  hypothetical protein  37.5 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2541  hypothetical protein  37.5 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000693132 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2556  hypothetical protein  27.78 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0257422  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4768  hypothetical protein  39.62 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.611837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3048  hypothetical protein  29.82 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.810584  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3006  hypothetical protein  29.82 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863054  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3923  hypothetical protein  28.57 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119406  decreased coverage  0.00597108 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0068  hypothetical protein  35.71 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.550883  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>