41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1373 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A3024  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  206  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0862773  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3153  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  206  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515124  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1373  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  206  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577002  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6051  hypothetical protein  78.22 
 
 
99 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0458725 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6459  hypothetical protein  79.21 
 
 
99 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.624579  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1370  hypothetical protein  79.21 
 
 
99 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0344819  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5637  hypothetical protein  79.79 
 
 
99 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.364961  normal  0.0737283 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1974  hypothetical protein  98.72 
 
 
78 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6385  hypothetical protein  79.79 
 
 
99 aa  158  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344963  normal  0.609556 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1282  hypothetical protein  98.72 
 
 
78 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37064  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0994  hypothetical protein  98.72 
 
 
78 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847178  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5455  hypothetical protein  74.26 
 
 
99 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632122 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3607  hypothetical protein  49.32 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4912  hypothetical protein  45.83 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5253  hypothetical protein  40.62 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0436617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3285  hypothetical protein  48 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1279  hypothetical protein  39.68 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157817  normal  0.180796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0951  hypothetical protein  50.85 
 
 
64 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1780  hypothetical protein  45.76 
 
 
64 aa  62.8  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3400  hypothetical protein  46.67 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00844504  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2095  hypothetical protein  41.07 
 
 
62 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2094  hypothetical protein  41.07 
 
 
62 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44400  hypothetical protein  43.94 
 
 
64 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4768  hypothetical protein  41.82 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.611837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5166  hypothetical protein  42.62 
 
 
63 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000077985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2014  hypothetical protein  36.07 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2993  hypothetical protein  40 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948652  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2541  hypothetical protein  37.93 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000693132 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1672  hypothetical protein  37.93 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3048  hypothetical protein  38.33 
 
 
82 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.810584  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3006  hypothetical protein  38.33 
 
 
82 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863054  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  40.68 
 
 
526 aa  47  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1453  hypothetical protein  39.62 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.297138  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1255  hypothetical protein  32.73 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  35.59 
 
 
399 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1261  hypothetical protein  39.66 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388151  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1064  hypothetical protein  35.71 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1358  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2881  hypothetical protein  27.5 
 
 
81 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00637074  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2556  hypothetical protein  31.03 
 
 
77 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0257422  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1055  hypothetical protein  35.71 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000280368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>