19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2881 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2881  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  167  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00637074  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2556  hypothetical protein  43.06 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0257422  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0068  hypothetical protein  36.92 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.550883  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5455  hypothetical protein  38.67 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632122 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6385  hypothetical protein  38.67 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344963  normal  0.609556 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5637  hypothetical protein  38.67 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.364961  normal  0.0737283 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2094  hypothetical protein  36.07 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6459  hypothetical protein  37.33 
 
 
99 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.624579  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1370  hypothetical protein  37.33 
 
 
99 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0344819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2095  hypothetical protein  36.07 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6051  hypothetical protein  38.33 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0458725 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1360  hypothetical protein  29.85 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44400  hypothetical protein  35.19 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6514  hypothetical protein  38.6 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1780  hypothetical protein  32.2 
 
 
64 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3006  hypothetical protein  35 
 
 
82 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863054  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3048  hypothetical protein  35 
 
 
82 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.810584  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3211  hypothetical protein  36.84 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.47234  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3095  hypothetical protein  35.09 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00697991  hitchhiker  0.00154018 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>