19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3211 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_3211  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  197  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.47234  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3095  hypothetical protein  96.34 
 
 
82 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00697991  hitchhiker  0.00154018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6514  hypothetical protein  91.46 
 
 
82 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3177  hypothetical protein  90.24 
 
 
82 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0330701  hitchhiker  0.0000310225 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2545  hypothetical protein  87.8 
 
 
82 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0768609  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3159  hypothetical protein  87.8 
 
 
82 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0975559  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3151  hypothetical protein  87.8 
 
 
82 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213868  hitchhiker  0.0000000948825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1261  hypothetical protein  77.46 
 
 
76 aa  120  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388151  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2286  hypothetical protein  77.14 
 
 
76 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1972  hypothetical protein  79.71 
 
 
76 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192327  normal  0.0363609 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2095  hypothetical protein  33.93 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4507  hypothetical protein  48.08 
 
 
111 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1780  hypothetical protein  43.18 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4912  hypothetical protein  43.86 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2094  hypothetical protein  30.36 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1055  hypothetical protein  36.07 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000280368  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5253  hypothetical protein  29.51 
 
 
77 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0436617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2881  hypothetical protein  36.84 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00637074  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2014  hypothetical protein  40.43 
 
 
63 aa  41.2  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>