33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1055 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1055  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000280368  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1261  hypothetical protein  38.46 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1780  hypothetical protein  35.71 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0068  hypothetical protein  37.7 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.550883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6514  hypothetical protein  37.7 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2545  hypothetical protein  37.7 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0768609  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3159  hypothetical protein  37.7 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0975559  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1972  hypothetical protein  37.29 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192327  normal  0.0363609 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3177  hypothetical protein  37.7 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0330701  hitchhiker  0.0000310225 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2286  hypothetical protein  38.89 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3095  hypothetical protein  37.7 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00697991  hitchhiker  0.00154018 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4912  hypothetical protein  44.23 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3151  hypothetical protein  38.6 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213868  hitchhiker  0.0000000948825 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0471  hypothetical protein  39.62 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3211  hypothetical protein  36.07 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.47234  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5253  hypothetical protein  41.3 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0436617 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2554  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1647  hypothetical protein  35.85 
 
 		 75 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0538  hypothetical protein  39.22 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0493  hypothetical protein  42.86 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.947797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  36.51 
 
 		 526 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1282  hypothetical protein  35.71 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37064  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0994  hypothetical protein  35.71 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847178  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1279  hypothetical protein  45.45 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157817  normal  0.180796 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0177  hypothetical protein  37.74 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1974  hypothetical protein  35.71 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0534  hypothetical protein  37.74 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3400  hypothetical protein  36.36 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00844504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0368  hypothetical protein  47.06 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128991 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0464  hypothetical protein  38.3 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3153  hypothetical protein  35.71 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3024  hypothetical protein  35.71 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0862773  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1373  hypothetical protein  35.71 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>