20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0177 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0177  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0653  hypothetical protein  86.67 
 
 
75 aa  137  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.75011  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1647  hypothetical protein  86.67 
 
 
75 aa  136  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0534  hypothetical protein  85.33 
 
 
75 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0471  hypothetical protein  85.33 
 
 
75 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0538  hypothetical protein  81.33 
 
 
75 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0493  hypothetical protein  77.33 
 
 
75 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.947797  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0464  hypothetical protein  59.72 
 
 
73 aa  98.2  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0286  hypothetical protein  58.33 
 
 
85 aa  97.1  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5003  hypothetical protein  58.33 
 
 
73 aa  95.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3979  hypothetical protein  58.33 
 
 
73 aa  94  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0178163  normal  0.514914 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2554  hypothetical protein  64.79 
 
 
73 aa  92  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5701  hypothetical protein  56.94 
 
 
73 aa  92.8  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09096  hypothetical protein  56.94 
 
 
73 aa  92.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0368  hypothetical protein  56.94 
 
 
73 aa  91.7  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2575  hypothetical protein  56.94 
 
 
73 aa  90.5  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.924076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6891  hypothetical protein  55.56 
 
 
73 aa  90.9  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.39159 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1844  hypothetical protein  54.17 
 
 
73 aa  89.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3923  hypothetical protein  36 
 
 
138 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119406  decreased coverage  0.00597108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1055  hypothetical protein  37.74 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000280368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>