18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6891 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6891  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  145  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.39159 
 
 
-
 
NC_002950  PG0286  hypothetical protein  87.67 
 
 		 85 aa  131  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5701  hypothetical protein  84.93 
 
 		 73 aa  130  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3979  hypothetical protein  83.56 
 
 		 73 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0178163  normal  0.514914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1844  hypothetical protein  83.56 
 
 		 73 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2575  hypothetical protein  84.93 
 
 		 73 aa  128  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.924076 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0464  hypothetical protein  78.08 
 
 		 73 aa  122  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09096  hypothetical protein  76.71 
 
 		 73 aa  119  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5003  hypothetical protein  76.71 
 
 		 73 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2554  hypothetical protein  78.87 
 
 		 73 aa  111  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0368  hypothetical protein  72.6 
 
 		 73 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128991 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0534  hypothetical protein  58.33 
 
 		 75 aa  94  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1647  hypothetical protein  58.33 
 
 		 75 aa  93.6  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0471  hypothetical protein  56.94 
 
 		 75 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0177  hypothetical protein  55.56 
 
 		 75 aa  90.9  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0493  hypothetical protein  53.42 
 
 		 75 aa  90.1  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.947797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0538  hypothetical protein  55.56 
 
 		 75 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0653  hypothetical protein  54.17 
 
 		 75 aa  87.4  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.75011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>