19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2554 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2554  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  142  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3979  hypothetical protein  83.1 
 
 
73 aa  121  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0178163  normal  0.514914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5701  hypothetical protein  81.69 
 
 
73 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1844  hypothetical protein  78.87 
 
 
73 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2575  hypothetical protein  80.28 
 
 
73 aa  117  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.924076 
 
 
-
 
NC_002950  PG0286  hypothetical protein  75.34 
 
 
85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6891  hypothetical protein  78.87 
 
 
73 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.39159 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09096  hypothetical protein  74.65 
 
 
73 aa  107  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0368  hypothetical protein  73.24 
 
 
73 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128991 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0464  hypothetical protein  73.24 
 
 
73 aa  105  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5003  hypothetical protein  71.83 
 
 
73 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0534  hypothetical protein  66.2 
 
 
75 aa  94  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1647  hypothetical protein  64.79 
 
 
75 aa  93.2  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0471  hypothetical protein  63.38 
 
 
75 aa  92.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0177  hypothetical protein  64.79 
 
 
75 aa  92  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0538  hypothetical protein  63.38 
 
 
75 aa  90.1  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0493  hypothetical protein  61.97 
 
 
75 aa  89  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.947797  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0653  hypothetical protein  59.15 
 
 
75 aa  86.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.75011  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1055  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000280368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>