34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3607 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3607  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  245  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3285  hypothetical protein  94.4 
 
 		 125 aa  228  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0951  hypothetical protein  58.93 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4768  hypothetical protein  56.9 
 
 		 71 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.611837 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6385  hypothetical protein  42.71 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344963  normal  0.609556 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5637  hypothetical protein  42.71 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.364961  normal  0.0737283 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6051  hypothetical protein  39.58 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0458725 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1370  hypothetical protein  40.62 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0344819  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6459  hypothetical protein  40.62 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.624579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5455  hypothetical protein  40.62 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632122 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1780  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4912  hypothetical protein  49.25 
 
 		 77 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3153  hypothetical protein  51.79 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3024  hypothetical protein  51.79 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0862773  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1373  hypothetical protein  51.79 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577002  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1974  hypothetical protein  51.79 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0994  hypothetical protein  51.79 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847178  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1282  hypothetical protein  51.79 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37064  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3400  hypothetical protein  47.37 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00844504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5253  hypothetical protein  43.86 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0436617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44400  hypothetical protein  47.27 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2095  hypothetical protein  44.44 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2094  hypothetical protein  44.44 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1064  hypothetical protein  44.44 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1279  hypothetical protein  42.11 
 
 		 92 aa  50.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157817  normal  0.180796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2014  hypothetical protein  42.31 
 
 		 63 aa  48.9  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2541  hypothetical protein  42.11 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000693132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2993  hypothetical protein  39.29 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948652  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1672  hypothetical protein  42.11 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3625  hypothetical protein  33.93 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4044  hypothetical protein  30 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345099  normal  0.110238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3667  hypothetical protein  30.19 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11440  hypothetical protein  41.51 
 
 		 104 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3923  hypothetical protein  34.62 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119406  decreased coverage  0.00597108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>