21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3667 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3667  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4044  hypothetical protein  84.13 
 
 		 63 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345099  normal  0.110238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0951  hypothetical protein  37.93 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1780  hypothetical protein  30.19 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1279  hypothetical protein  31.48 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157817  normal  0.180796 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1255  hypothetical protein  27.27 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2095  hypothetical protein  28.07 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2014  hypothetical protein  25.45 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3607  hypothetical protein  30.19 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2094  hypothetical protein  26.32 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5253  hypothetical protein  30.19 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0436617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3625  hypothetical protein  26.32 
 
 		 133 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1064  hypothetical protein  37.74 
 
 		 63 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4912  hypothetical protein  34.62 
 
 		 77 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6051  hypothetical protein  30.91 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0458725 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44400  hypothetical protein  26.92 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6459  hypothetical protein  30.91 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.624579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1370  hypothetical protein  30.91 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0344819  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2993  hypothetical protein  27.27 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948652  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3400  hypothetical protein  27.78 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00844504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3285  hypothetical protein  30.19 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>