32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1672 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1672  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2541  hypothetical protein  84.16 
 
 		 101 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000693132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2993  hypothetical protein  56.25 
 
 		 73 aa  77.4  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948652  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44400  hypothetical protein  50.85 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2014  hypothetical protein  47.37 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5637  hypothetical protein  46.88 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.364961  normal  0.0737283 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6385  hypothetical protein  45.31 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344963  normal  0.609556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1370  hypothetical protein  43.75 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0344819  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6459  hypothetical protein  43.75 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.624579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3400  hypothetical protein  44.83 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00844504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6051  hypothetical protein  40.62 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0458725 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5166  hypothetical protein  45.61 
 
 		 63 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000077985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2095  hypothetical protein  44.07 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2094  hypothetical protein  44.07 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5455  hypothetical protein  42.19 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632122 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3006  hypothetical protein  36.36 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863054  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3048  hypothetical protein  36.36 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.810584  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1373  hypothetical protein  38.6 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577002  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3153  hypothetical protein  38.6 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3024  hypothetical protein  38.6 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0862773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0951  hypothetical protein  42.11 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  43.86 
 
 		 399 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1282  hypothetical protein  38.6 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37064  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0994  hypothetical protein  38.6 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847178  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1974  hypothetical protein  38.6 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1780  hypothetical protein  38.6 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 526 aa  47  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1083  hypothetical protein  35.09 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3607  hypothetical protein  42.11 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1255  hypothetical protein  41.18 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3285  hypothetical protein  42.11 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4654  hypothetical protein  33.93 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>