20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1083 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1083  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  271  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0068  hypothetical protein  46.46 
 
 
145 aa  124  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.550883  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  28.57 
 
 
399 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2095  hypothetical protein  48.53 
 
 
62 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  30.07 
 
 
526 aa  51.6  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2094  hypothetical protein  45.59 
 
 
62 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1255  hypothetical protein  42.86 
 
 
84 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2993  hypothetical protein  35.38 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948652  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1672  hypothetical protein  37.25 
 
 
98 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2541  hypothetical protein  37.25 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000693132 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1780  hypothetical protein  37.25 
 
 
64 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4912  hypothetical protein  36.54 
 
 
77 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5253  hypothetical protein  33.9 
 
 
77 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0436617 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5637  hypothetical protein  36.36 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.364961  normal  0.0737283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3006  hypothetical protein  26.87 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863054  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3048  hypothetical protein  26.87 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.810584  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6385  hypothetical protein  36.36 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344963  normal  0.609556 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2014  hypothetical protein  34.69 
 
 
63 aa  40.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1055  hypothetical protein  30.43 
 
 
72 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000280368  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4768  hypothetical protein  39.22 
 
 
71 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.611837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>