18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1453 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1453  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  224  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.297138  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2003  hypothetical protein  51.46 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00035748  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4507  hypothetical protein  42.31 
 
 
111 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11440  hypothetical protein  36.36 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5455  hypothetical protein  45.28 
 
 
99 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632122 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1370  hypothetical protein  45.28 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0344819  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6459  hypothetical protein  45.28 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.624579  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5637  hypothetical protein  43.4 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.364961  normal  0.0737283 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6385  hypothetical protein  43.4 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344963  normal  0.609556 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6051  hypothetical protein  43.4 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0458725 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1373  hypothetical protein  39.62 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577002  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3153  hypothetical protein  39.62 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3024  hypothetical protein  39.62 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0862773  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2095  hypothetical protein  41.18 
 
 
62 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0994  hypothetical protein  39.62 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847178  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1282  hypothetical protein  39.62 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37064  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1974  hypothetical protein  39.62 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2094  hypothetical protein  39.22 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>