56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7512 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7512  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  410  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2819  putative transcriptional regulator  29.8 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  29.57 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  30.65 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5097  DeoR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5102  transcriptional regulator, DeoR family  27.44 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4686  DeoR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000645179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4781  putative transcriptional regulator  27.44 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0136  transcriptional regulator, DeoR family  26.98 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.790585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  27.57 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4828  DeoR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00756639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5064  transcriptional regulator, DeoR family  26.98 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5193  DeoR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.076054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4669  DeoR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3558  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5103  transcriptional regulator, DeoR family  26.98 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4354  transcriptional regulator  25.22 
 
 		 228 aa  62  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  26.85 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13330  predicted transcriptional regulator  27.27 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3070  transcriptional regulator, TrmB  25.94 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272047 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0425  putative transcriptional regulator  26.39 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.973468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2060  MarR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000547125  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1733  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.86463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4139  putative transcriptional regulator  24.88 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.936463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  26.49 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 243 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0077  transcriptional regulator  27.86 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.53122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4804  putative transcriptional regulator  23.08 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000646734 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0307  putative transcriptional regulator  28.37 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.519243  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1043  hypothetical protein  27 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0030  hypothetical protein  27 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0384  hypothetical protein  27 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1200  hypothetical protein  27 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1579  hypothetical protein  27 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1494  hypothetical protein  27 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1289  hypothetical protein  26.87 
 
 		 253 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2786  putative transcriptional regulator  23.19 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5538  putative transcriptional regulator  24.74 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.912326  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  25.71 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21960  predicted transcriptional regulator  28.44 
 
 		 275 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3238  putative transcriptional regulator  25.24 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4997  putative transcriptional regulator  20.69 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1452  putative transcriptional regulator  25.82 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0423  transcriptional regulator  26.51 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956901  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001755  predicted transcriptional regulator  21.63 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  22.68 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03001  regulatory proteins, AsnC family protein  24.54 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.764788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08010  transcriptional regulator/sugar kinase  33.61 
 
 		 368 aa  42.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2296  putative transcriptional regulator  28.09 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000358822  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3788  hypothetical protein  24.61 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4136  hypothetical protein  24.61 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0028  transcriptional regulator  24.19 
 
 		 217 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.572077  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0414  putative transcriptional regulator  24.86 
 
 		 220 aa  41.6  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.802259  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0018  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 214 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3358  putative transcriptional regulator  22.22 
 
 		 220 aa  41.6  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338727  normal  0.270871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>