42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2303 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2303  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1691  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2326  hypothetical protein  99.38 
 
 		 321 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288478  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2222  PRC-barrel domain-containing protein  92.55 
 
 		 322 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5645  hypothetical protein  96.37 
 
 		 324 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0975  hypothetical protein  94.17 
 
 		 309 aa  527  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2342  PRC-barrel domain-containing protein  92.36 
 
 		 321 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0995  hypothetical protein  63.78 
 
 		 280 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1055  hypothetical protein  57.47 
 
 		 326 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0813  putative lipoprotein  57.47 
 
 		 326 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1209  putative lipoprotein  57.47 
 
 		 326 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0338  putative lipoprotein  57.47 
 
 		 326 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.560334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1368  hypothetical protein  57.14 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1901  hypothetical protein  57.47 
 
 		 387 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1217  putative lipoprotein  57.14 
 
 		 326 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1822  hypothetical protein  54.3 
 
 		 343 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0915856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1522  hypothetical protein  53.07 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2952  hypothetical protein  51.64 
 
 		 331 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3321  PRC-barrel domain protein  40.54 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal  0.282972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3445  PRC-barrel domain protein  40.91 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3124  PRC-barrel domain-containing protein  40.91 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7367  PRC-barrel domain protein  35.58 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00459502  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  41.11 
 
 		 193 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3526  PRC-barrel domain-containing protein  38.57 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0419  PRC-barrel  37.5 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  39.33 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6618  PRC-barrel domain-containing protein  36.56 
 
 		 179 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235295  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1277  PRC-barrel domain protein  32.23 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  33.33 
 
 		 157 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.016878 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  23.58 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  22.92 
 
 		 280 aa  54.3  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  22.92 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  22.96 
 
 		 284 aa  50.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  28.83 
 
 		 157 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  28.57 
 
 		 142 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  28.23 
 
 		 2449 aa  47  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  24.68 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  37.78 
 
 		 211 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  29.87 
 
 		 131 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3608  PRC-barrel domain protein  29.87 
 
 		 131 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  38.46 
 
 		 187 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3485  PRC-barrel domain protein  30.67 
 
 		 135 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999892  normal  0.263816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>