43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2342 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2342  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 		 321 aa  624  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2222  PRC-barrel domain-containing protein  97.2 
 
 		 322 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2303  hypothetical protein  92.36 
 
 		 323 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1691  hypothetical protein  92.36 
 
 		 323 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2326  hypothetical protein  91.69 
 
 		 321 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288478  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0975  hypothetical protein  90.35 
 
 		 309 aa  511  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5645  hypothetical protein  92.03 
 
 		 324 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0995  hypothetical protein  65.75 
 
 		 280 aa  295  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1217  putative lipoprotein  59.09 
 
 		 326 aa  291  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1368  hypothetical protein  59.09 
 
 		 436 aa  292  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0338  putative lipoprotein  59.42 
 
 		 326 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.560334  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1055  hypothetical protein  59.42 
 
 		 326 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0813  putative lipoprotein  59.42 
 
 		 326 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1209  putative lipoprotein  59.42 
 
 		 326 aa  291  8e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1901  hypothetical protein  59.42 
 
 		 387 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1822  hypothetical protein  55.05 
 
 		 343 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0915856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1522  hypothetical protein  51.63 
 
 		 320 aa  248  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2952  hypothetical protein  50.83 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3321  PRC-barrel domain protein  40.54 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal  0.282972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3445  PRC-barrel domain protein  40.91 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3124  PRC-barrel domain-containing protein  40.91 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7367  PRC-barrel domain protein  36.19 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00459502  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0419  PRC-barrel  39.39 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3526  PRC-barrel domain-containing protein  40 
 
 		 255 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  39.33 
 
 		 144 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  40 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6618  PRC-barrel domain-containing protein  35.87 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235295  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1277  PRC-barrel domain protein  33.85 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  27.12 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  32.58 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.016878 
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  22.92 
 
 		 280 aa  53.9  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  22.92 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  23.98 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  29.87 
 
 		 142 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  26.47 
 
 		 234 aa  46.2  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  40.82 
 
 		 157 aa  46.2  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1389  PRC-barrel domain protein  27.38 
 
 		 148 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  35.23 
 
 		 2449 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  31.03 
 
 		 187 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3192  PRC-barrel domain-containing protein  26.19 
 
 		 212 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  28.57 
 
 		 131 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3485  PRC-barrel domain protein  30.67 
 
 		 135 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999892  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3608  PRC-barrel domain protein  28.57 
 
 		 131 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>