38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1822 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1822  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  664    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0915856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1522  hypothetical protein  62.62 
 
 
320 aa  291  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2222  PRC-barrel domain-containing protein  54.95 
 
 
322 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2303  hypothetical protein  52.52 
 
 
323 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1691  hypothetical protein  52.52 
 
 
323 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2342  PRC-barrel domain-containing protein  55.41 
 
 
321 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2326  hypothetical protein  54.11 
 
 
321 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288478  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0975  hypothetical protein  56.54 
 
 
309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5645  hypothetical protein  54.67 
 
 
324 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1368  hypothetical protein  55 
 
 
436 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1217  putative lipoprotein  54.06 
 
 
326 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2952  hypothetical protein  58.28 
 
 
331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0813  putative lipoprotein  53.75 
 
 
326 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1055  hypothetical protein  53.75 
 
 
326 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1209  putative lipoprotein  53.75 
 
 
326 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0338  putative lipoprotein  53.75 
 
 
326 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.560334  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1901  hypothetical protein  54.69 
 
 
387 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0995  hypothetical protein  59.85 
 
 
280 aa  265  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3321  PRC-barrel domain protein  37.07 
 
 
210 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal  0.282972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7367  PRC-barrel domain protein  36.36 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00459502  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3445  PRC-barrel domain protein  37.65 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424077  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3124  PRC-barrel domain-containing protein  37.65 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6618  PRC-barrel domain-containing protein  36.08 
 
 
179 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235295  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3526  PRC-barrel domain-containing protein  40.24 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0419  PRC-barrel  35.51 
 
 
169 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  32.35 
 
 
193 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  25.54 
 
 
250 aa  60.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  37.18 
 
 
157 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.016878 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1277  PRC-barrel domain protein  36.59 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244172  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  23.51 
 
 
284 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  25.24 
 
 
280 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  25.24 
 
 
280 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  30.26 
 
 
157 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  32.86 
 
 
187 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  28 
 
 
234 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1389  PRC-barrel domain protein  25 
 
 
148 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  29.41 
 
 
131 aa  42.7  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>