36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1055 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0338  putative lipoprotein  100 
 
 
326 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.560334  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1209  putative lipoprotein  100 
 
 
326 aa  624  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0813  putative lipoprotein  100 
 
 
326 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1055  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1901  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1217  putative lipoprotein  99.39 
 
 
326 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1368  hypothetical protein  99.39 
 
 
436 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0995  hypothetical protein  90.66 
 
 
280 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2222  PRC-barrel domain-containing protein  58.93 
 
 
322 aa  318  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2342  PRC-barrel domain-containing protein  60 
 
 
321 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2326  hypothetical protein  57.7 
 
 
321 aa  315  9e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288478  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1691  hypothetical protein  57.7 
 
 
323 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2303  hypothetical protein  57.7 
 
 
323 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5645  hypothetical protein  58.36 
 
 
324 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0975  hypothetical protein  59.18 
 
 
309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1522  hypothetical protein  53.75 
 
 
320 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1822  hypothetical protein  56.01 
 
 
343 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0915856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2952  hypothetical protein  52.38 
 
 
331 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7367  PRC-barrel domain protein  37.63 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00459502  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3321  PRC-barrel domain protein  40.66 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal  0.282972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3445  PRC-barrel domain protein  40.51 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424077  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3124  PRC-barrel domain-containing protein  40.51 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6618  PRC-barrel domain-containing protein  37.8 
 
 
179 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235295  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3526  PRC-barrel domain-containing protein  34.82 
 
 
255 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  37.5 
 
 
144 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  37.36 
 
 
193 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  24.32 
 
 
250 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  25.91 
 
 
280 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0419  PRC-barrel  33.71 
 
 
169 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  27.64 
 
 
284 aa  56.2  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  25 
 
 
280 aa  56.2  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1277  PRC-barrel domain protein  35.44 
 
 
260 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244172  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  29.76 
 
 
157 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.016878 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
526 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  29.11 
 
 
142 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  27.62 
 
 
400 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>