162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0602 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0602  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  383  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.547374  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  51.63 
 
 
233 aa  208  3e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.820137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  50.89 
 
 
155 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21900  SUF system FeS assembly protein, NifU family  46.2 
 
 
178 aa  149  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1676  SUF system FeS assembly protein, NifU family  48.21 
 
 
171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610224  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1145  SUF system FeS assembly protein, NifU family  46.63 
 
 
178 aa  145  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  45.88 
 
 
154 aa  142  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  44.83 
 
 
155 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  42.94 
 
 
151 aa  137  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  44.69 
 
 
160 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  43.79 
 
 
153 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  43.79 
 
 
153 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  43.79 
 
 
153 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.1 
 
 
147 aa  134  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.2 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  43.2 
 
 
153 aa  132  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.6 
 
 
163 aa  131  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  44.44 
 
 
151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2069  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.29 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.420514  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  44.71 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2958  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.24 
 
 
158 aa  128  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  41.67 
 
 
145 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  42.6 
 
 
156 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3305  NifU family SUF system FeS assembly protein  42.01 
 
 
158 aa  124  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286575 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1294  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.53 
 
 
149 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000198269 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.7 
 
 
157 aa  122  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3078  NifU family SUF system FeS assembly protein  42.01 
 
 
158 aa  122  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167444  normal  0.201859 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  39.05 
 
 
162 aa  121  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.27 
 
 
151 aa  120  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.16 
 
 
146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1236  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.37 
 
 
161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2335  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.71 
 
 
191 aa  115  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.610109  normal  0.712132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.78 
 
 
167 aa  112  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000288131  hitchhiker  0.00804986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  37.28 
 
 
145 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.32 
 
 
163 aa  105  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.5 
 
 
137 aa  104  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.67 
 
 
153 aa  100  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.29 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  34.13 
 
 
149 aa  98.2  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  34.71 
 
 
149 aa  98.2  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.71 
 
 
137 aa  98.2  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16670  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.74 
 
 
152 aa  97.1  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0471636  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  34.48 
 
 
147 aa  96.7  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.12 
 
 
149 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.12 
 
 
149 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.23 
 
 
153 aa  95.1  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.33 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.33 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.12 
 
 
151 aa  91.7  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0269  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.54 
 
 
148 aa  91.7  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  34.32 
 
 
147 aa  90.9  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0652  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.43 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  33.33 
 
 
152 aa  88.2  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2035  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  31.4 
 
 
144 aa  88.2  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.52 
 
 
151 aa  88.2  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0221  NifU family protein  36.78 
 
 
144 aa  87.8  8e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.53 
 
 
139 aa  87  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.37 
 
 
165 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.93 
 
 
149 aa  86.3  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0988  NifU family protein  41.59 
 
 
126 aa  85.5  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.77 
 
 
141 aa  85.5  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.21 
 
 
159 aa  84.3  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  30.3 
 
 
153 aa  84  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.36 
 
 
149 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  28.4 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  28.4 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  35.48 
 
 
163 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.64 
 
 
154 aa  82  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.68 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  30.51 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  30.51 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  30.51 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.51 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  30.51 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  31.98 
 
 
160 aa  80.5  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.51 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2920  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.53 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26820  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.07 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.51 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1110  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  30.59 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.56 
 
 
135 aa  77  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.28 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.73 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.28 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0398  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.5 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0499  NifU domain-containing protein  31.55 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2274  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.34 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12880  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.88 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0118  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  32.75 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  32.14 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  35.09 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1864  SUF system FeS assembly protein  35.19 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.861958  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1070  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.06 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5117  NifU domain-containing protein  32.16 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4848  NifU domain-containing protein  32.16 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4704  NifU family protein  32.16 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5214  NifU domain-containing protein  32.16 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5085  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  32.16 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4802  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.16 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5120  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  32.16 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>