76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1813 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1813    100 
 
 		 510 bp  1011    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3911  transposase  96.46 
 
 		 1110 bp  809    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6919  transposase  96.46 
 
 		 1110 bp  809    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7153  transposase  96.46 
 
 		 1110 bp  809    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3414  transposase, IS4  84.58 
 
 		 1110 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3391  transposase, IS4  84.58 
 
 		 1110 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3290  transposase, IS4  84.58 
 
 		 1110 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3140  transposase, IS4  84.58 
 
 		 1110 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3113  transposase, IS4  84.58 
 
 		 1110 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2596  transposase, IS4  84.58 
 
 		 1110 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3440  transposase, IS4  84.58 
 
 		 1110 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0308754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2160  transposase, IS4  84.58 
 
 		 1110 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1821  transposase, IS4  84.58 
 
 		 1110 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1690  ISGsu2, transposase  84.58 
 
 		 804 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0288166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1653  transposase, IS4  84.58 
 
 		 1110 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891331  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1498  transposase, IS4  84.58 
 
 		 1110 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1473  transposase, IS4  84.58 
 
 		 1110 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282239  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1376  ISGsu2, transposase  84.58 
 
 		 807 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3552  transposase, IS4  84.58 
 
 		 1110 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1135  transposase, IS4  84.58 
 
 		 1110 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.064838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1095  transposase, IS4  84.58 
 
 		 1110 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0701  transposase, IS4  84.58 
 
 		 1110 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0512  transposase, IS4  84.58 
 
 		 1110 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.692808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3654  transposase, IS4  84.58 
 
 		 1110 bp  377  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2499  ISGsu3, transposase  85.38 
 
 		 351 bp  274  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0247  ISGsu3, transposase  85.38 
 
 		 351 bp  274  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.425976  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0013  ISGsu3, transposase  85.38 
 
 		 351 bp  274  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0180659  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5660  transposase IS4 family protein  83.07 
 
 		 1098 bp  192  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1266  transposase, IS4  82.03 
 
 		 1023 bp  170  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0246  transposase, IS4  88.07 
 
 		 726 bp  105  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.261546  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2500  transposase, IS4  88.07 
 
 		 726 bp  105  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0014  transposase, IS4  88.07 
 
 		 726 bp  105  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0462942  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4885  transposase IS4 family protein  88.61 
 
 		 1107 bp  85.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00514  putative ISXoo14 transposase  87.34 
 
 		 1002 bp  77.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00235  putative ISXoo14 transposase  87.34 
 
 		 1098 bp  77.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02785  putative ISXoo14 transposase  87.34 
 
 		 1110 bp  77.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1803  putative transposase  85.39 
 
 		 1107 bp  73.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3903  hypothetical protein  92.45 
 
 		 297 bp  65.9  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.762031  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0529    84.09 
 
 		 723 bp  63.9  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117782 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4713    84.81 
 
 		 1102 bp  61.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0412243  normal  0.806779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02389    89.09 
 
 		 240 bp  61.9  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270456  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1527  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  60  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.717674  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2770  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  60  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3984  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  60  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3889  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  60  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3700  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  60  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3687  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  60  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3098  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  60  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2726  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  60  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0495453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1112  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  60  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0987  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  60  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6302  transposase, IS4 family protein  88.89 
 
 		 1104 bp  60  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5960  transposase, IS4 family protein  88.89 
 
 		 1104 bp  60  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5505  transposase, IS4 family protein  88.89 
 
 		 1104 bp  60  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.60603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2894  transposase, IS4 family protein  88.89 
 
 		 1104 bp  60  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.457818  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5596  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  60  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5376  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  60  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490407  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3131  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  60  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347053  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2594  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  60  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2279  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  60  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4641  transposase, IS4  94.44 
 
 		 669 bp  56  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.395706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1171  IS4 family transposase  92.5 
 
 		 1101 bp  56  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.56171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3353  IS4 family transposase  92.5 
 
 		 1101 bp  56  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4153  transposase ISRme1  92.5 
 
 		 1101 bp  56  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.504697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4228  transposase ISRme1  92.5 
 
 		 1101 bp  56  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00917968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6370    100 
 
 		 1374 bp  54  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2609  hypothetical protein  85.48 
 
 		 621 bp  52  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.763724  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2394    87.04 
 
 		 192 bp  52  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.71257  normal  0.119767 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2168  transposase, IS4  80.53 
 
 		 1101 bp  50.1  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238923  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0419  transposase, IS4 family protein  91.89 
 
 		 1095 bp  50.1  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2105  transposase, IS4  87.5 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3230  transposase IS4 family protein  90 
 
 		 1104 bp  48.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3062  transposase  93.75 
 
 		 561 bp  48.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1433  transposase, IS4 family protein  93.75 
 
 		 1218 bp  48.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1688  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 2709 bp  46.1  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.524019 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2611  hypothetical protein  100 
 
 		 447 bp  46.1  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>