More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2499 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2499  ISGsu3, transposase  100 
 
 		 116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0013  ISGsu3, transposase  100 
 
 		 116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0180659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0247  ISGsu3, transposase  100 
 
 		 116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.425976  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1821  transposase, IS4  100 
 
 		 369 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1473  transposase, IS4  100 
 
 		 369 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282239  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3113  transposase, IS4  100 
 
 		 369 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2596  transposase, IS4  100 
 
 		 369 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2160  transposase, IS4  100 
 
 		 369 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1653  transposase, IS4  100 
 
 		 369 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891331  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3414  transposase, IS4  100 
 
 		 369 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3391  transposase, IS4  100 
 
 		 369 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3290  transposase, IS4  100 
 
 		 369 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3552  transposase, IS4  100 
 
 		 369 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3654  transposase, IS4  100 
 
 		 369 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3440  transposase, IS4  100 
 
 		 369 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0308754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3140  transposase, IS4  100 
 
 		 369 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1498  transposase, IS4  100 
 
 		 369 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0512  transposase, IS4  100 
 
 		 369 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.692808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0701  transposase, IS4  100 
 
 		 369 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1095  transposase, IS4  100 
 
 		 369 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1135  transposase, IS4  100 
 
 		 369 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.064838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1690  ISGsu2, transposase  100 
 
 		 267 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0288166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1376  ISGsu2, transposase  100 
 
 		 268 aa  209  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3911  transposase  87.38 
 
 		 369 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7153  transposase  87.38 
 
 		 369 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6919  transposase  87.38 
 
 		 369 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5660  transposase IS4 family protein  76.92 
 
 		 365 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1266  transposase, IS4  71.84 
 
 		 340 aa  153  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1433  transposase, IS4 family protein  65.05 
 
 		 405 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3062  transposase  60.34 
 
 		 186 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2168  transposase, IS4  61.17 
 
 		 366 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238923  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0419  transposase, IS4 family protein  57.14 
 
 		 364 aa  123  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2105  transposase, IS4  59.22 
 
 		 366 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2772  ISGsu3, transposase  54.37 
 
 		 362 aa  120  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4153  transposase ISRme1  56.48 
 
 		 366 aa  120  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.504697 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3353  IS4 family transposase  56.48 
 
 		 366 aa  120  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1171  IS4 family transposase  56.48 
 
 		 366 aa  120  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.56171 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4228  transposase ISRme1  56.48 
 
 		 366 aa  120  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00917968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4885  transposase IS4 family protein  57.41 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3230  transposase IS4 family protein  56.48 
 
 		 367 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00235  putative ISXoo14 transposase  55.56 
 
 		 365 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5975  IS4 family transposase  54.63 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3706  transposase, IS4 family protein  49.51 
 
 		 354 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0559  ISGsu2, transposase  49.51 
 
 		 361 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1297  ISGsu2, transposase  49.51 
 
 		 361 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2597  ISGsu2, transposase  49.51 
 
 		 361 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3116  transposase IS4 family protein  50.49 
 
 		 360 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000441936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0839  transposase IS4 family protein  50.49 
 
 		 360 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000787198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0006  transposase IS4 family protein  50.49 
 
 		 360 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2513  transposase IS4 family protein  50.49 
 
 		 360 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000127835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1681  transposase IS4 family protein  50.49 
 
 		 360 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0330564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2311  transposase IS4 family protein  50.49 
 
 		 360 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000514015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2694  transposase IS4 family protein  50.49 
 
 		 360 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00558684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0155  transposase IS4 family protein  50.49 
 
 		 360 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0440  transposase IS4 family protein  50.49 
 
 		 360 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6786  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6134  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 368 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.647313  normal  0.885579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4641  transposase, IS4  50.93 
 
 		 222 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.395706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4959  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 368 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3918  transposase, IS4 family protein  50.49 
 
 		 362 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2685  transposase, IS4 family protein  50.49 
 
 		 362 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235088  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1916  transposase, IS4 family protein  50.49 
 
 		 362 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.176419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3184  transposase, IS4 family protein  50.49 
 
 		 362 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2866  transposase, IS4 family protein  50.49 
 
 		 362 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.953499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3410  transposase, IS4 family protein  50.49 
 
 		 362 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3703  transposase, IS4 family protein  50.49 
 
 		 362 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3613  transposase, IS4 family protein  50.49 
 
 		 362 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3331  transposase, IS4 family protein  50.49 
 
 		 362 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1519  transposase, IS4 family protein  50.49 
 
 		 362 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1871  transposase, IS4 family protein  50.49 
 
 		 362 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.85058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0089  transposase, IS4 family protein  50.49 
 
 		 362 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0754  transposase, IS4 family protein  50.49 
 
 		 362 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0576  transposase, IS4 family protein  50.49 
 
 		 362 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78227  normal  0.0868679 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1230  transposase, IS4 family protein  50.49 
 
 		 362 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2122  transposase, IS4 family protein  50.49 
 
 		 362 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.973511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0806  transposase, IS4 family protein  50.49 
 
 		 362 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1431  transposase, IS4 family protein  50.49 
 
 		 362 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0686  transposase IS4 family protein  49.51 
 
 		 362 aa  104  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.278758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2015  transposase IS4 family protein  49.51 
 
 		 362 aa  104  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1337  transposase IS4 family protein  49.51 
 
 		 362 aa  104  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0222  transposase IS4 family protein  49.51 
 
 		 362 aa  104  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1803  putative transposase  49.06 
 
 		 368 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2124  transposase IS4 family protein  49.51 
 
 		 365 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.436654  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3903  hypothetical protein  72.31 
 
 		 98 aa  100  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.762031  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02785  putative ISXoo14 transposase  57.32 
 
 		 369 aa  99.4  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0283  transposase IS4  49.51 
 
 		 358 aa  97.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1069  transposase IS4  49.51 
 
 		 358 aa  97.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0456377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2091  transposase IS4  49.51 
 
 		 358 aa  97.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000396436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2240  transposase IS4  49.51 
 
 		 358 aa  97.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000126004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2488  transposase IS4  49.51 
 
 		 358 aa  97.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2883  transposase IS4  49.51 
 
 		 358 aa  97.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446649 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3283  transposase IS4  49.51 
 
 		 337 aa  97.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2770  transposase, IS4  54.37 
 
 		 367 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3984  transposase, IS4  54.37 
 
 		 367 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0987  transposase, IS4  54.37 
 
 		 367 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3700  transposase, IS4  54.37 
 
 		 367 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3098  transposase, IS4  54.37 
 
 		 367 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1112  transposase, IS4  54.37 
 
 		 367 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2726  transposase, IS4  54.37 
 
 		 367 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0495453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3687  transposase, IS4  54.37 
 
 		 367 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>